1型糖尿病不一致单卵双生子单核细胞、T细胞和B细胞的BLUEPRINT DNA甲基化450K图谱
数据为1型糖尿病不一致单卵双生子的单核细胞、T细胞和B细胞的BLUEPRINT DNA甲基化图谱,基于450K平台。可用于比较同一遗传背景下不同免疫细胞类型的DNA甲基化差异,探索1型糖尿病相关的表观遗传特征(来源 omicsdi.org)

基本信息
资源简介
1型糖尿病不一致单卵双生子单核细胞、T细胞和B细胞的BLUEPRINT DNA甲基化450K图谱
WP8_DNA_Methylation_450K_UCL 是一个聚焦于1型糖尿病表观遗传学研究的DNA甲基化数据集,来源于 omicsdi.org,在本站归入内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病分类。该数据集收录了1型糖尿病不一致单卵双生子的单核细胞、T细胞和B细胞的BLUEPRINT DNA甲基化图谱,检测基于450K平台完成。其核心价值在于:单卵双生子共享同一遗传背景,而疾病状态不一致,因此可在控制遗传差异的条件下比较不同免疫细胞类型的DNA甲基化特征,为探索1型糖尿病相关的表观遗传机制提供数据基础。数据集的主题标签为 Genomics,整体属于基因组学范畴的免疫细胞表观遗传资源。
【数据集背景】
1型糖尿病是一种由免疫系统介导的代谢性疾病,其发生发展涉及遗传与环境因素的共同作用。表观遗传修饰,尤其是DNA甲基化,被认为是连接环境暴露与基因表达调控的重要桥梁。单卵双生子在遗传序列上高度一致,但1型糖尿病的发病状态可以不一致,这种“疾病不一致单卵双生子”设计为研究表观遗传差异提供了天然的比较框架。该数据集正是在这一研究背景下产生,依托BLUEPRINT项目对免疫细胞DNA甲基化图谱的刻画工作,将研究对象限定为1型糖尿病不一致单卵双生子的单核细胞、T细胞和B细胞三类免疫细胞,基于450K平台获取甲基化谱,用于在相同遗传背景下考察免疫细胞表观遗传特征与疾病状态之间的关联。
【数据内容】
数据集包含的生物学材料为1型糖尿病不一致单卵双生子的外周免疫细胞,具体细胞类型包括单核细胞、T细胞和B细胞。数据类型为DNA甲基化图谱,检测平台为450K。主题标签为 Genomics。源站描述明确指出其为“BLUEPRINT DNA methylation profiles of monocytes, T cells and B cells in type 1 diabetes-discordant monozygotic twins”,即BLUEPRINT项目框架下上述三类免疫细胞在1型糖尿病不一致单卵双生子中的DNA甲基化谱。关于样本数量、具体受试者信息、甲基化位点数量、数据文件格式与大小等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,英文名称为 WP8_DNA_Methylation_450K_UCL。其原始描述指向BLUEPRINT项目的DNA甲基化图谱工作,研究对象为1型糖尿病不一致单卵双生子的单核细胞、T细胞和B细胞,检测基于450K平台。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、测序或芯片实验的操作细节、数据处理管线等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于在统一遗传背景下比较不同免疫细胞类型之间DNA甲基化差异的研究,尤其适合围绕1型糖尿病展开的表观遗传特征探索。由于研究对象为疾病不一致的单卵双生子,可用于考察疾病状态与免疫细胞甲基化谱之间的关联,也可用于单核细胞、T细胞与B细胞三类免疫细胞之间的横向比较。主题标签 Genomics 表明其可服务于基因组学与表观基因组学方向的分析工作。关于具体的分析用途验证或已发表的研究结论,源站未提供。
【使用方法】
使用该数据集时,可围绕单卵双生子对内的疾病不一致设计开展配对比较,并在单核细胞、T细胞和B细胞之间进行细胞类型层面的差异分析。分析中应充分考虑同一遗传背景这一特点,将个体间遗传差异的影响降至较低水平,从而突出甲基化层面的差异信号。关于数据下载方式、文件组织格式、预处理步骤与推荐分析工具,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于450K平台,属于芯片类DNA甲基化检测,其覆盖范围受平台设计所限。研究对象为1型糖尿病不一致单卵双生子,样本设计具有独特性,但也意味着样本来源相对特殊。关于样本量、数据完整性、质控指标、批次效应以及数据可能存在的其他技术限制,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、文献出处、许可协议与使用条款,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00010001025
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
BLUEPRINT DNA methylation profiles of monocytes, T cells and B cells in type 1 diabetes-discordant monozygotic twins
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