用于自动渗出物检测与糖尿病视网膜病变分级的SUSTech-SYSU数据集

该数据集包含1219张眼底图像,来自糖尿病视网膜病变患者与健康对照,并带有渗出物病灶标注。除渗出物标注外,每张图像还提供四项附加标签:左右眼标签、三种不同分级方案给出的DR严重程度分级、视盘边界框以及黄斑中心凹位置

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2020-11-20 更新
浏览 10
图像目标检测the SUSTech-SYSU datasetexudatesdetection algorithmDiabetic Retinopathy (DR)Diabetic retinopathy (DR) gradingoptic disc (OD) detectionfovea locationBiological TechniquesImage Processing
The SUSTech-SYSU dataset for automated exudate detection and diabetic retinopathy grading

基本信息

模态
图像
大小
0.437670761 GB
任务类型
目标检测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2020-11-20
版本
v1

资源简介

用于自动渗出物检测与糖尿病视网膜病变分级的SUSTech-SYSU数据集

The SUSTech-SYSU dataset for automated exudate detection and diabetic retinopathy grading

该数据集包含1219张眼底图像,来自糖尿病视网膜病变患者与健康对照,并带有渗出物病灶标注。除渗出物标注外,每张图像还提供四项附加标签:左右眼标签、三种不同分级方案给出的DR严重程度分级、视盘边界框以及黄斑中心凹位置。该数据集可用于自动渗出物检测、糖尿病视网膜病变筛查与分级评估,以及视盘检测和黄斑中心凹定位等相关研究,为监督或半监督学习方法提供训练与评测数据(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

项目资助方:the Shenzhen Basic Research Program (JCYJ20190809120205578)。源站首次发布:2020-11-03。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):从眼底图像中自动检测渗出物在糖尿病视网膜病变(DR)筛查和评估中起着重要作用,为此通常更倾向于采用监督或半监督学习方法。然而,基于监督和半监督学习的检测算法的一个潜在局限是,它们在很大程度上依赖于训练数据的样本量和标注质量,这正是本工作的根本动机。在本研究中,我们构建了一个包含1219张眼底图像(来自DR患者和健康对照)的数据集,并带有渗出物病灶标注。除渗出物标注外,我们还为每张图像提供四个附加标签:左右眼标签、来自三种不同分级方案的DR分级(严重程度量表)、视盘(OD)的边界框以及黄斑中心凹位置。该数据集提供了一个很好的机会

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 437.67 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.12570770.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Bioinformatic methods development、Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified、Other biological sciences not elsewhere classified、Artificial intelligence not elsewhere classified、Image processing。主题标签:the SUSTech-SYSU dataset、exudates、detection algorithm、Diabetic Retinopathy (DR)、Diabetic retinopathy (DR) grading、optic disc (OD) detection、fovea location、Biological Techniques、Image Processing。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Bioinformatic methods development、Bioinformatics and computational biology not elsewhere classified、Other biological sciences not elsewhere classified、Artificial intelligence not elsewhere classified、Image processing。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/The_SUSTech-SYSU_dataset_for_automated_exudate_detection_and_diabetic_retinopathy_grading/12570770

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Lin, Li; Li, Meng; Huang, Yijin; Cheng, Pujin; Xia, Honghui; Wang, Kai; et al. (2020). The SUSTech-SYSU dataset for automated exudate detection and diabetic retinopathy grading. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2020-11-20,引用时请注意版本时效。

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源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.12570770.v1

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 437.7 MB。

数据说明

从眼底图像中自动检测渗出物在糖尿病视网膜病变(DR)筛查与评估中具有重要作用,对此通常更倾向于采用监督或半监督学习方法。然而,基于监督和半监督学习的检测算法的一个潜在局限在于,它们在很大程度上依赖于训练数据的样本量和注释质量,这也是本工作的基本动机。在本研究中,我们构建了一个包含1219张眼底图像(来自DR患者和健康对照)的数据集,并附有渗出物病变的注释。除了渗出物注释外,我们还为每张图像提供了四个额外标签:左眼与右眼标签、来自三种不同分级方案的DR等级(严重程度量表)、视盘(OD)的边界框以及黄斑中心凹位置。该数据集为分析不同渗出物检测、OD检测、黄斑中心凹定位及DR分类算法的准确性和可靠性提供了绝佳机会。此外,它将促进监督和半监督学习领域中此类算法的开发。

使用本数据集的研究人员在利用该数据集产生的任何研究成果中,均需引用以下论文,并适当鸣谢本数据集的贡献。——Li Lin等人:用于自动渗出物检测和糖尿病视网膜病变分级的SUSTech-SYSU数据集,《科学数据》。https://doi.org/10.1038/s41597-020-00755-0

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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