对照(db/m)与糖尿病(db/db)小鼠血浆和肾组织的代谢组学

该数据集来自代谢组学工作台,包含对照(db/m)与糖尿病(db/db)小鼠的血浆和肾组织样本,采用LC-MS技术进行代谢组学检测,物种为Mus musculus,来源机构为University of Michigan

University of MichiganUniversity of Michigan
metabolomics_workbench
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基因组分类LC-MS
ST001292: Metabolomics of blood plasma and kidney tissue from control (db/m) and diabetic (db/db) mice.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

对照(db/m)与糖尿病(db/db)小鼠血浆和肾组织的代谢组学

ST001292 是一个公开的代谢组学数据集,全称为“Metabolomics of blood plasma and kidney tissue from control (db/m) and diabetic (db/db) mice”,收录于代谢组学工作台(metabolomicsworkbench.org),在本站归类于内分泌、营养和代谢疾病领域下的糖尿病方向。该数据集围绕对照小鼠(db/m)与糖尿病小鼠(db/db)展开,采集其血浆与肾组织两类样本,采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)技术进行代谢组学检测,实验物种为小鼠(Mus musculus),数据来源机构为密歇根大学(University of Michigan)。整体而言,该数据集为研究糖尿病状态下血浆与肾脏组织的代谢变化提供了可参考的原始代谢组学资料。

【数据集背景】

糖尿病是一种以糖代谢紊乱为核心特征的内分泌与代谢性疾病,其发生发展往往伴随全身多组织、多通路的代谢重编程。db/db 小鼠是代谢研究中常用的糖尿病模型动物,而 db/m 小鼠则作为其对照,用于区分疾病相关变化与遗传背景或基础状态带来的差异。该数据集正是在这一研究框架下产生,旨在通过代谢组学手段比较对照与糖尿病小鼠在血浆和肾组织中的代谢谱差异。数据集所属分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病,主题标签为 LC-MS,说明其技术路线以液相色谱-质谱联用为核心。

【数据内容】

该数据集包含两类生物样本:血浆(blood plasma)与肾组织(kidney tissue)。样本分别来自对照组(db/m)小鼠和糖尿病组(db/db)小鼠,因此构成“两种基因型/表型 × 两种组织类型”的基本样本结构。检测内容为代谢组学,采用 LC-MS 技术完成。数据集名称本身即概括了其核心内容,即对照与糖尿病小鼠血浆及肾组织的代谢组学数据。除上述信息外,关于具体代谢物数量、鉴定结果、定量数值、样本量、分组重复数等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 metabolomicsworkbench.org,即代谢组学工作台。源站描述指出,这是一项代谢组学研究,采用 LC-MS 技术,研究物种为 Mus musculus,来源机构为 University of Michigan。数据集英文名中明确标注了样本类型为 blood plasma 和 kidney tissue,分组为 control (db/m) 与 diabetic (db/db)。关于样本采集的具体时间点、饲养条件、组织取材与处理流程、质谱参数、色谱条件等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于糖尿病相关代谢机制研究、血浆与肾组织代谢谱比较分析、db/db 与 db/m 小鼠模型差异代谢物筛选,以及 LC-MS 代谢组学数据处理方法的教学与验证等场景。由于同时涵盖血浆和肾组织,该数据集也可用于探索糖尿病状态下循环系统与肾脏组织之间代谢变化的关联。关于该数据集是否已被用于特定疾病机制结论或生物标志物验证,源站未提供。

【使用方法】

使用者可通过来源站 metabolomicsworkbench.org 获取该数据集,并按照该平台的一般数据访问与下载流程进行使用。由于数据集标注为 LC-MS 代谢组学,使用时可结合液相色谱-质谱数据处理流程,对原始数据进行峰提取、代谢物鉴定与统计分析。关于该数据集的具体文件格式、下载方式、是否提供原始谱图或处理后数据矩阵、推荐分析软件与参数等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自代谢组学工作台,来源机构为 University of Michigan,物种与分组信息明确,技术路线为 LC-MS。其限制在于,当前可获得的信息仅覆盖数据集名称、分类、来源、物种、机构、样本类型、分组与技术标签,关于样本量、重复数、质控策略、缺失值处理、代谢物鉴定置信度、定量方法及统计结果等关键质量信息,源站未提供。因此在使用该数据集时,应结合来源站的原始记录进一步核实数据质量与适用范围。

【引用与许可】

该数据集来源于 metabolomicsworkbench.org,来源机构为 University of Michigan。关于该数据集的具体引用格式、作者列表、发表文献、数据许可协议及使用条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应查阅来源站的相关说明以确认引用与许可要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://metabolomicsworkbench.org/data/DRCCMetadata.php?Mode=Study&StudyID=ST001292

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Metabolomics study (LC-MS). Species: Mus musculus. Institute: University of Michigan.

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