单细胞视角解析糖尿病视网膜病变机制

该数据集源自 clinicaltrials.gov,聚焦糖尿病视网膜病变的发病机制研究。研究由上海市第一人民医院发起,计划采集因晚期增殖性糖尿病视网膜病变致盲而接受义眼植入的 3 例患者及 3 例正常遗体捐献者的视网膜组织,用于单细胞测序与生物信息学分析,同时采集 30 例患者的房水、玻璃体液和血浆

Shanghai General Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of MedicineShanghai General Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine
clinicaltrials
浏览 13
基因组分类Diabetic Retinopathy
Single-Cell Insights Into Diabetic Retinopathy Mechanisms

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

单细胞视角解析糖尿病视网膜病变机制

该数据集英文名为 Single-Cell Insights Into Diabetic Retinopathy Mechanisms,来源于 clinicaltrials.gov,本站归类于内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病方向,主题标签为 Diabetic Retinopathy。糖尿病视网膜病变是全球劳动人口致盲的首要原因,但其发病机制尚未被完全阐明,有效的预防和治疗手段也较为有限。该研究由上海市第一人民医院发起,拟借助单细胞测序等方法探索该病发生过程中的细胞与分子机制,以识别新的干预靶点。研究计划采集因晚期增殖性糖尿病视网膜病变致盲而接受义眼植入的 3 例患者,以及 3 例正常遗体捐献者的视网膜组织,用于单细胞测序与生物信息学分析;同时还将采集 30 例患者的房水、玻璃体液和血浆样本。

【数据集背景】

糖尿病视网膜病变是全球劳动人口中导致失明的主要原因。然而,其发病机制目前尚未被完全理解,有效的预防和治疗方法也比较有限。基于这一背景,上海市第一人民医院发起本研究,旨在通过单细胞测序等方法,探索糖尿病视网膜病变发生背后的细胞与分子机制,并据此寻找新的干预靶点。该数据集即围绕这一研究目标而建立,聚焦于糖尿病视网膜病变的机制探索。

【数据内容】

该数据集的核心内容来自单细胞测序与生物信息学分析。研究计划采集两类视网膜组织样本:一类来自因晚期增殖性糖尿病视网膜病变致盲而接受义眼植入的 3 例患者,另一类来自 3 例正常遗体捐献者。上述视网膜组织将用于单细胞测序及后续的生物信息学分析。此外,研究还将采集 30 例患者的房水、玻璃体液和血浆样本。除上述样本类型与数量外,源站未提供关于具体数据字段、测序平台、分析流程或数据规模的更多信息。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 clinicaltrials.gov,研究由上海市第一人民医院发起。样本采集地点为上海市第一人民医院眼科。采集对象包括:因晚期增殖性糖尿病视网膜病变致盲而接受义眼植入的患者 3 例,正常遗体捐献者 3 例,以及 30 例患者。采集的样本类型包括视网膜组织、房水、玻璃体液和血浆。其中视网膜组织用于单细胞测序与生物信息学分析。关于样本采集的具体时间窗口、伦理审批信息及入组标准等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于糖尿病视网膜病变发病机制相关的研究场景,尤其是从细胞与分子层面探索疾病发生过程、识别潜在干预靶点的研究方向。借助单细胞测序与生物信息学分析,可用于比较晚期增殖性糖尿病视网膜病变患者与正常供体视网膜组织之间的差异。同时,房水、玻璃体液和血浆样本的采集也为相关样本类型的分析提供了可能。除此之外的具体应用场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集所涉及的视网膜组织计划用于单细胞测序和生物信息学分析。关于数据的具体获取方式、访问流程、分析工具、数据处理步骤及使用规范等,源站未提供。

【质量与限制】

该研究的样本量较小,包括 3 例晚期增殖性糖尿病视网膜病变患者的视网膜组织、3 例正常遗体捐献者的视网膜组织,以及 30 例患者的房水、玻璃体液和血浆样本。研究由上海市第一人民医院发起,采集地点为该院眼科。关于样本质量、数据完整性、批次效应、测序深度及潜在偏倚等具体质量与限制信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 clinicaltrials.gov。关于引用格式、许可条款、数据共享政策及使用限制等信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT06497608

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:糖尿病视网膜病变。糖尿病视网膜病变是全球工作人群中致盲的首要原因。然而,其发病机制尚未完全阐明,有效的预防和治疗方法有限。本研究由上海市第一人民医院发起,旨在通过单细胞测序等方法探索其发生的细胞和分子机制,以确定新的干预靶点。本研究计划从上海市第一人民医院眼科收集因晚期增殖性糖尿病视网膜病变致盲而接受义眼植入的3例患者以及3例正常尸体供体的视网膜组织样本,用于单细胞测序和生物信息学分析。此外,还将从30例需要手术的严重糖尿病视网膜病变患者和30例无糖尿病视网膜病变的黄斑裂孔手术患者中收集房水、玻璃体液和血浆样本。

这些样本将接受ELISA、qPCR和Western Blot等实验,以验证测序结果,探究糖尿病视网膜病变的发病机制,并确定潜在的治疗靶点。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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