年轻自身抗体阳性儿童快速进展为1型糖尿病的血清APOC1水平降低

该数据集来自omicsdi.org,聚焦内分泌、营养和代谢疾病中的糖尿病领域,主题为蛋白质组学。源站描述了一项研究,旨在寻找能在1型糖尿病症状前异质期准确预测和监测疾病进展的生物标志物

omicsdi
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蛋白质预测Proteomics
Serum APOC1 levels are decreased in young autoantibody positive children who rapidly progress to type 1 diabetes

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-22

资源简介

年轻自身抗体阳性儿童快速进展为1型糖尿病的血清APOC1水平降低

该数据集来自omicsdi.org,聚焦内分泌、营养和代谢疾病中的糖尿病领域,主题为蛋白质组学。源站描述了一项研究,旨在寻找能在1型糖尿病症状前异质期准确预测和监测疾病进展的生物标志物。研究对具有HLA遗传风险的5岁以下儿童进行纵向血浆和血清蛋白质组分析,样本采集自出生至诊断期间。采用基于质谱的发现蛋白质组学,比较了多种自身抗体阳性且4岁前快速进展为1型糖尿病的儿童(n=10)与年龄性别匹配的单一自身抗体阳性(n=10)或自身抗体阴性(n=10)儿童。该数据可用于探索1型糖尿病早期进展的蛋白质组学标志物(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的/假设:需要生物标志物来在疾病发展的症状前阶段(该阶段高度异质)准确预测和监测1型糖尿病的进展。为解决这一问题,我们研究了具有HLA遗传风险的5岁以下儿童血浆和血清蛋白质组的时间变化,通过分析出生至诊断期间定期采集的纵向样本系列。方法:使用基于质谱的发现蛋白质组学,分析了多种自身抗体阳性且在4岁前快速进展为1型糖尿病的儿童的纵向样本系列(n=10),并与年龄和性别匹配的单一自身抗体阳性(n=10)或自身抗体阴性(n=10)儿童的类似测量结果进行比较。在使用附加方法分析数据后

【主题与分类】

主题标签:Proteomics。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/panorama/PXD033946

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的/假设:在1型糖尿病发展的症状前期,疾病进展存在显著异质性,因此需要生物标志物来准确预测和监测这一过程。为解决这一问题,我们研究了具有HLA遗传风险的5岁以下儿童血浆和血清蛋白质组的时间变化,通过分析从出生到诊断期间定期采集的纵向样本系列。方法:采用基于质谱的发现蛋白质组学,分析了多种自身抗体阳性且在4岁前快速进展为1型糖尿病的儿童的纵向样本系列(n=10),并与年龄和性别匹配的单一自身抗体阳性儿童(n=10)或自身抗体阴性儿童(n=10)的类似测量结果进行比较。在使用加性高斯过程回归模型(LonGP)分析数据后,采用靶向蛋白质组学在一个类似但独立的儿童队列中验证了11个候选生物标志物,该队列包括在5岁内进展为疾病的儿童(n=31)和匹配的自身抗体阴性儿童(n=31)。

结果:这些数据重申了幼儿蛋白质水平随年龄变化的广泛趋势。此外,通过将LonGP的效用与在采样点更密集的扩展队列中进行的靶向分析相结合,这些分析表明,与自身抗体阴性儿童相比,两种载脂蛋白C1(APOC1)特有肽段的血清水平在首个胰岛自身抗体出现后下降,并且在后来进展为1型糖尿病的儿童中保持相对较低的丰度。结论/解释:通过对前瞻性收集样本的比较分析,我们的数据表明,在幼年发展为1型糖尿病的胰岛自身抗体阳性儿童中,APOC1的血清/血浆水平降低。在未来的研究中,APOC1可能被用

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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