糖尿病患者及其他病理患者尿液拉曼光谱数据集

该数据集包含去标识化人类患者尿液的原始未处理拉曼光谱,覆盖健康志愿者、慢性肾脏病合并或不合并糖尿病患者、活检确诊的糖尿病肾病、免疫介导性肾病、膜性肾病、肾脏肿瘤及其他肾小球病变患者,以及尿液分析对照样本

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2024-07-15 更新
浏览 3
医学影像分类Raman spectroscopychronic kidney diseasediabetes mellitusdiabetic nephropathy
Raman spectra of urine from patients with diabetes mellitus and other pathologies

基本信息

模态
医学影像
大小
0.144407073 GB
任务类型
分类
许可
cc-by
创建/更新时间
2024-07-15

资源简介

糖尿病患者及其他病理患者尿液拉曼光谱数据集

Raman spectra of urine from patients with diabetes mellitus and other pathologies

该数据集包含去标识化人类患者尿液的原始未处理拉曼光谱,覆盖健康志愿者、慢性肾脏病合并或不合并糖尿病患者、活检确诊的糖尿病肾病、免疫介导性肾病、膜性肾病、肾脏肿瘤及其他肾小球病变患者,以及尿液分析对照样本。光谱由 Agiltron PeakSeeker PRO-785 Mo 拉曼光谱仪采集,并附有去标识化元数据、患者知情同意书和 IRB 批准文件。数据可用于比较不同病理状态下尿液拉曼光谱差异,支撑糖尿病及其相关肾脏疾病的分类与鉴别研究(来源 Zenodo,cc-by 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2022-11-21。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含去标识化人类患者尿液的原始(未处理)拉曼光谱。本数据集的分析收录于我们的期刊文章《Analysis of urine Raman spectra differences from patients with diabetes mellitus and other pathologies》中。数据集包括以下来源的尿液拉曼光谱:(1)健康志愿者,(2)慢性肾脏病合并糖尿病患者,(3)慢性肾脏病不合并糖尿病患者,(4)活检确诊的糖尿病肾病患者,(5)活检确诊的免疫介导性肾病患者,(5)活检确诊的膜性肾病患者,(6)活检确诊的肾脏肿瘤患者,(7)其他肾小球病变患者,以及(8)Surine(尿液分析对照)。拉曼光谱采用以下参数获得:拉曼光谱仪:Agiltron Peak

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 144.41 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.7343559。

【主题与分类】

主题标签:Raman spectroscopy、chronic kidney disease、diabetes mellitus、diabetic nephropathy。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/7343559

使用许可:cc-by。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-07-15,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

curl -L -o "Glomerular Pathologies - De-identified Metadata.tsv" "https://zenodo.org/api/records/7343559/files/Glomerular%20Pathologies%20-%20De-identified%20Metadata.tsv/content"
curl -L -o "Patient consent form.pdf" "https://zenodo.org/api/records/7343559/files/Patient%20consent%20form.pdf/content"
curl -L -o "Glomerular Pathologies - Raw Spectral Data.tsv" "https://zenodo.org/api/records/7343559/files/Glomerular%20Pathologies%20-%20Raw%20Spectral%20Data.tsv/content"
curl -L -o "IRB approval.pdf" "https://zenodo.org/api/records/7343559/files/IRB%20approval.pdf/content"

文件清单

  • Glomerular Pathologies - De-identified Metadata.tsv(0.0 MB)
  • Patient consent form.pdf(0.1 MB)
  • Glomerular Pathologies - Raw Spectral Data.tsv(137.5 MB)
  • IRB approval.pdf(0.1 MB)

数据集大小约 144.4 MB。

数据说明

该数据集包含去标识化人类患者尿液的原始(未处理)拉曼光谱。该数据集的分析收录于我们的期刊文章《糖尿病患者与其他病理患者尿液拉曼光谱差异分析》中。该数据集包括来自以下人群的尿液拉曼光谱:(1) 健康志愿者,(2) 慢性肾脏病合并糖尿病患者,(3) 慢性肾脏病非糖尿病患者,(4) 经活检确诊的糖尿病肾病患者,(5) 经活检确诊的免疫介导性肾病患者,(5) 经活检确诊的膜性肾病患者,(6) 经活检确诊的肾脏肿瘤患者,(7) 其他肾小球病理患者,以及 (8) Surine(尿液分析对照)。拉曼光谱采用以下参数获取:拉曼光谱仪:Agiltron PeakSeeker PRO-785 模式:散装液体扫描 波长:785 nm 波数范围:200-2000 cm-1 激光功率:30 mW 光谱分辨率:8 cm-1 激光光斑大小:0.2 mm 激发时间:30 s 拉曼光谱数据和去标识化元数据以制表符分隔值(tsv)文件形式提供。

每个尿液样本均通过条形码标识,并与元数据tsv文件中的疾病状态(或对照组)相关联。每个尿液样本有十(10)个独立的拉曼扫描重复,并在光谱数据tsv文件中通过条形码标识。此处还包括研究IRB批准书和样本空白患者同意书。

许可

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