PRJEB50261：口腔感染糖耐量异常与胰岛素抵抗研究——龈下菌斑第二波
数据围绕口腔感染、糖耐量异常与胰岛素抵抗研究，采集龈下菌斑第二波样本，可用于探索口腔微生物与糖代谢异常、胰岛素抵抗之间的关联，支撑糖尿病相关代谢研究的分类与分析（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
PRJEB50261：口腔感染糖耐量异常与胰岛素抵抗研究——龈下菌斑第二波
PRJEB50261 是一个围绕口腔感染、糖耐量异常与胰岛素抵抗主题建立的生物项目数据集，其完整英文名称为 Oral Infections Glucose Intolerance and Insulin Resistance Study - subgingival plaque wave 2。该数据集聚焦于龈下菌斑样本的第二波采集，属于内分泌、营养和代谢疾病领域中与糖尿病相关的研究资源。从名称和分类来看，它旨在为探索口腔微生物与糖代谢异常、胰岛素抵抗之间的潜在关联提供数据支撑，适合用于糖尿病相关代谢研究的分类、整理与分析。数据集来源于 NCBI 的 BioProject 记录，主题标签为 Other，整体定位偏向口腔微生物组与代谢紊乱交叉方向的基础研究数据集合。
【数据集背景】
该数据集对应的研究主题为口腔感染、糖耐量异常与胰岛素抵抗，属于内分泌、营养和代谢疾病分类下的糖尿病相关研究方向。其英文名称中明确包含 subgingival plaque wave 2，表明该数据是同一研究项目中龈下菌斑样本的第二波采集内容。BioProject 作为生物数据的集合，通常围绕某一项单一研究计划或由某一机构、联盟发起，旨在为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种类型数据。该数据集正是此类项目记录之一，主题标签为 Other，源站标题显示为 ID 799571 - BioProject - NCBI。
【数据内容】
该数据集围绕口腔感染、糖耐量异常与胰岛素抵抗研究，采集龈下菌斑第二波样本。其内容可用于探索口腔微生物与糖代谢异常、胰岛素抵抗之间的关联，并支撑糖尿病相关代谢研究的分类与分析。关于样本的具体数量、测序类型、微生物种类、临床指标数值等详细信息，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 ID 799571 - BioProject - NCBI。该记录属于 BioProject 类型，即围绕单一研究计划或由单一机构、联盟发起的生物数据集合。BioProject 记录为用户提供统一位置，以查找该项目产生的多种数据类型。关于龈下菌斑第二波样本的具体采集地点、采集时间、受试者信息、采样流程等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于口腔微生物与糖代谢异常、胰岛素抵抗之间关联的探索性研究，也可支撑糖尿病相关代谢研究的分类与分析。其主题涉及口腔感染、糖耐量异常与胰岛素抵抗，适合在内分泌、营养和代谢疾病，尤其是糖尿病研究方向中作为数据资源使用。关于具体的分析流程、统计方法或建模用途，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法、数据下载方式、文件格式或分析工具说明。用户可依据 BioProject 记录的一般用途，将其作为查找该项目多种数据类型的入口。关于如何访问、提取或处理该数据集中的具体数据，源站未提供。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、样本量、覆盖度、偏差控制或技术验证的具体信息。该数据集为龈下菌斑第二波样本，属于特定研究项目的一部分，其使用应结合项目整体设计理解。关于数据完整性、准确性或适用性限制，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用格式、许可条款或使用限制。用户如需引用或使用，应参考 NCBI BioProject 记录 ID 799571 的相关说明。关于具体的引用要求与许可信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB50261
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
牙周炎影响全球高达50%的人口[1]，其中8.5%被诊断为糖尿病[2]。这两种疾病的高共病率可能至少部分表明它们具有共同的病因学和病理生理学。在严重牙周炎和糖尿病的背景下，口腔微生物群落的变化已被记录，无论是独立发生还是同时存在。然而，对于这些疾病的早期口腔微生物标志物，人们所知甚少。我们使用了ORIGINS项目数据集的一个子集，该数据集收集了787名健康个体的详细牙周和心血管代谢信息，以识别牙周炎的早期微生物标志物及其与心血管代谢健康标志物的关联。利用最先进的成分数据分析工具，我们发现密螺旋体与棒状杆菌细菌的对数比是一种新型的牙周炎微生物指标（MIP），并发现该MIP与疾病发病早期龈下菌斑和唾液中的牙周健康状况不佳和心血管代谢标志物相关。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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