MHLBW治疗db/db小鼠肾皮质转录组测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJDB45014

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在探究中药复方MHLBW对糖尿病肾病的治疗作用机制。采用自发性2型糖尿病小鼠模型，对正常对照组小鼠、糖尿病突变小鼠及高剂量MHLBW治疗的糖尿病突变小鼠三个实验组的肾皮质组织进行RNA测序分析。每组包含五个生物学重复。从速冻肾皮质样本中提取总RNA，并采用链特异性方案构建测序文库。在Illumina NovaSeq 6000平台上进行双端测序，每个样本产生约4000万条reads。对原始数据进行处理以获得基因表达计数，后续生物信息学分析将包括差异表达和功能富集分析，以识别MHLBW治疗调控的关键通路和枢纽基因。该数据集为理解糖尿病肾病的进展及MHLBW的肾脏保护机制提供了全面的转录组资源。

所有动物实验均经机构动物护理委员会批准，并按照相关指南进行。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。