子代性别影响糖尿病患者胎盘DNA甲基化与基因表达
该数据集来自 dbGaP,采用嵌套病例对照设计,聚焦糖尿病患者中胎盘 DNA 甲基化与基因表达,并考察子代性别的影响。数据覆盖内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病主题,可用于分析子代性别与胎盘表观遗传及转录变化的关联,支持糖尿病相关胎盘机制的病例对照研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

基本信息
资源简介
子代性别影响糖尿病患者胎盘DNA甲基化与基因表达
phs001535: Offspring Sex Affects Placental DNA Methylation and Gene Expression in Diabetics 是一个收录于 NCBI dbGaP 的糖尿病相关研究数据集,采用嵌套病例对照设计,聚焦糖尿病患者胎盘中 DNA 甲基化与基因表达的变化,并重点考察子代性别在其中所产生的影响。该数据集在分类上归属于内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病主题,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。其核心价值在于将子代性别这一生物学变量与胎盘表观遗传及转录层面的改变联系起来,为探索糖尿病环境下胎盘机制的病例对照研究提供数据支撑,适用于分析子代性别与胎盘 DNA 甲基化、基因表达之间关联的研究场景。
【数据集背景】
该数据集来自 dbGaP 研究,研究设计类型为嵌套病例对照。其研究主题围绕糖尿病展开,归属于内分泌、营养和代谢疾病这一大类。研究的核心关注点是子代性别对糖尿病患者胎盘 DNA 甲基化与基因表达的影响,试图在糖尿病背景下揭示胎盘在表观遗传和转录层面的变化规律,并考察这些变化是否与子代性别相关。嵌套病例对照设计意味着该研究是在一个已有队列或人群基础上,嵌套开展病例与对照的选取与比较,这种设计通常用于在较大人群框架内研究相对少见的结果或机制性问题。源站描述仅标明其为 dbGaP study(Nested Case-Control),未提供更多关于研究假设、终点指标或样本量等信息。
【数据内容】
依据现有信息,该数据集的内容涉及胎盘 DNA 甲基化与基因表达两个层面的数据,并包含子代性别这一关键变量。研究将糖尿病作为背景条件,把胎盘组织中的表观遗传修饰(DNA 甲基化)与转录活动(基因表达)作为观察对象,同时引入子代性别作为可能影响上述指标的因素。数据集的主题标签为 Nested Case-Control,说明其数据结构与病例对照比较相关。除上述内容外,关于具体检测平台、甲基化位点数量、基因表达谱范围、样本例数、子代性别分布等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究收录的数据。源站描述将其标识为 dbGaP study,设计类型为 Nested Case-Control。关于样本采集的具体地点、时间跨度、纳入与排除标准、胎盘组织采集与处理流程、伦理审批信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于糖尿病相关胎盘机制的研究,尤其是需要考察子代性别与胎盘表观遗传及转录变化关联的分析。具体而言,可用于嵌套病例对照框架下比较糖尿病患者胎盘中 DNA 甲基化与基因表达的差异,并进一步分析这些差异是否因胎儿性别而不同。也可用于探索内分泌、营养和代谢疾病(特别是糖尿病)背景下胎盘生物学标志物的研究。由于采用病例对照设计,该数据适合开展关联性分析而非因果推断。其他潜在应用场景,源站未提供。
【使用方法】
关于该数据集的具体使用方法,包括数据访问方式、下载途径、所需分析工具、数据处理流程、统计模型选择等,源站未提供。使用者需依据 dbGaP 的通用数据访问规范自行了解获取与使用条件。
【质量与限制】
关于该数据集的质量控制指标、数据完整性、缺失情况、批次效应、样本量是否充分等质量相关信息,源站未提供。其设计类型为嵌套病例对照,此类设计在因果推断上存在固有局限,但源站未就此给出具体说明。其他限制条件,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用要求、许可条款、使用限制、数据共享政策等,源站未提供。使用者应参照 ncbi.nlm.nih.gov 及 dbGaP 的相关规定执行。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001535
标准获取流程:
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Nested Case-Control).
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