phs000140:非裔美国人2型糖尿病基因全基因组关联研究
该数据集来自 dbGaP,为病例对照研究,聚焦非裔美国人2型糖尿病相关基因的全基因组关联搜索。数据覆盖内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病主题,可用于探索遗传变异与2型糖尿病易感性之间的关联,支持病例与对照的分类比较分析,帮助识别潜在风险基因位点(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

基本信息
资源简介
phs000140:非裔美国人2型糖尿病基因全基因组关联研究
phs000140: A Whole Genome Association Search for Type 2 Diabetes Genes in African Americans 是一个面向非裔美国人群体、围绕2型糖尿病遗传基础的全基因组关联研究数据集。该数据集来源于 dbGaP,属于病例对照研究设计,主题分类为内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病。其核心目标是通过比较病例与对照之间的遗传变异分布,探索与非裔美国人2型糖尿病易感性相关的潜在基因位点。数据集覆盖全基因组关联搜索这一研究路径,可用于遗传变异与疾病风险之间关联的分析,支持病例与对照的分类比较。来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,整体定位清晰,适合用于糖尿病遗传学、群体遗传学以及疾病易感性相关的研究场景。
【数据集背景】
该数据集聚焦于非裔美国人群体中2型糖尿病的遗传关联研究。2型糖尿病属于内分泌、营养和代谢疾病范畴,其发生发展涉及遗传与环境等多重因素。针对非裔美国人群体开展全基因组关联搜索,有助于在特定遗传背景和群体结构下考察疾病易感性的遗传基础。数据集以病例对照研究为基本框架,旨在通过比较患病个体与未患病个体之间的遗传变异差异,识别可能与2型糖尿病相关的基因区域或位点。该研究主题与 dbGaP 所收录的遗传关联研究类型一致,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据内容】
该数据集为病例对照研究,主题标签为 Case-Control。其内容围绕非裔美国人2型糖尿病相关基因的全基因组关联搜索展开,覆盖内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病主题。数据可用于探索遗传变异与2型糖尿病易感性之间的关联,支持病例与对照的分类比较分析,帮助识别潜在风险基因位点。关于具体的样本量、标记数量、基因分型平台、变异位点列表、表型字段、随访信息或统计汇总结果等详细内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 dbGaP,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。源站将其描述为 dbGaP study,研究类型为 Case-Control。关于招募地点、招募时间、纳入与排除标准、样本采集流程、知情同意方式、伦理审批信息以及具体的调查或测量工具等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕非裔美国人2型糖尿病遗传易感性开展的研究场景。具体而言,可用于全基因组关联搜索背景下的病例与对照比较分析,探索遗传变异与2型糖尿病之间的关联,并帮助识别潜在风险基因位点。其主题分类为内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病,因此也可用于糖尿病遗传学、群体遗传学以及疾病易感性相关的研究。关于是否适用于药物基因组学、临床预测模型构建、纵向队列分析或跨群体比较等更具体的应用方向,源站未提供。
【使用方法】
该数据集来源于 dbGaP,属于病例对照研究。关于数据访问申请流程、下载方式、数据格式、分析工具、质量控制步骤、统计模型选择、协变量调整策略以及结果解释指南等具体使用方法,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 dbGaP 收录的病例对照研究,聚焦非裔美国人2型糖尿病的全基因组关联搜索。关于样本代表性、基因分型质量控制、缺失率、批次效应、群体分层校正、统计效力、多重检验校正、结果可重复性以及外推至其他人群的适用性等质量与限制信息,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集英文名称为 phs000140: A Whole Genome Association Search for Type 2 Diabetes Genes in African Americans,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于具体的引用格式、致谢要求、数据使用协议、许可条款、再分发限制或商业使用规定等,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000140
标准获取流程:
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Case-Control).
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