高危与1型糖尿病受试者T细胞对天然及新抗原胰岛表位应答的图谱

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-10323

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

来自用胰岛自身抗原肽刺激的T细胞群体的单细胞基因表达和T细胞受体谱。CD4 T细胞用天然（胰岛素原、GAD片段）或新抗原表位或流感疫苗（Pediacel）刺激。活化的细胞（鉴定为CD19- CD3+ CD4+、CD45-RO+ CD95+、CD154+CD69+ CD27+）通过FACS分选，样本条形码通过细胞哈希技术引入如下：患者1混合池1（Hashtag 1）；患者1混合池2（Hashtag 2）；患者2混合池1（Hashtag 3）；患者2混合池2（Hashtag 4）以及Pediacel（患者1和2；Hashtag 5）。Hashtag信息在ADT文件中，TCR序列提供在VDJ文件中。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。