纵向研究

该数据集来自 omicsdi.org,英文名为 Longitudinal study,归入内分泌系统疾病/糖尿病分类,主题标签为 Proteomics

omicsdi
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蛋白质Proteomics
Longitudinal study

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

纵向研究

Longitudinal study 是一个以蛋白质组学为主题的数据集,收录于 omicsdi.org,并在本站归入内分泌系统疾病 / 糖尿病分类。从源站给出的技术描述看,该数据集涉及经 iTRAQ 标记的 depleted serum(去 depleted 血清)样本,采用 SCX 分级分离,并通过 RP-LC Orbitrap-Velos 平台进行分析。这一组合表明数据属于基于质谱的血清蛋白质组学实验产物,围绕纵向研究设计展开,主题标签为 Proteomics。整体而言,该数据集面向内分泌系统疾病尤其是糖尿病方向的研究语境,可为血清蛋白层面的观察提供数据基础,但其具体样本规模、时间跨度与生物学结论需以源站记录为准。

【数据集背景】

该数据集英文名为 Longitudinal study,本站将其归入内分泌系统疾病 / 糖尿病分类,来源站为 omicsdi.org,主题标签为 Proteomics。从名称与分类可以看出,其设计指向纵向观察,并以蛋白质组学为技术主线,服务于内分泌系统疾病特别是糖尿病相关的研究场景。源站未提供该数据集的具体研究背景、立项目的、疾病亚型或队列定义等信息。

【数据内容】

源站描述为“iTRAQ labelled depleted serum, SCX fractionated, RP-LC Orbitrap-Velos”。据此,数据内容涉及经 iTRAQ 标记的去 depleted 血清样本,样本经过 SCX 分级分离后,采用 RP-LC Orbitrap-Velos 进行液相色谱-质谱分析。主题标签为 Proteomics,说明数据主体为蛋白质组学实验数据。源站未提供蛋白鉴定数量、定量结果、样本数量、时间点设置及数据文件格式等具体内容。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述给出了实验层面的技术路线信息,即 iTRAQ 标记、去 depleted 血清、SCX 分级与 RP-LC Orbitrap-Velos 分析。源站未提供样本采集机构、采集地点、采集时间、伦理审批及具体样本来源等详细信息。

【适用场景】

基于其分类与主题标签,该数据集可用于内分泌系统疾病 / 糖尿病方向的蛋白质组学数据查阅与方法参考,也可作为血清蛋白质组学中 iTRAQ 标记结合 SCX 分级与 RP-LC Orbitrap-Velos 分析流程的示例数据。源站未提供该数据集的具体应用案例、分析目标或验证结论。

【使用方法】

源站未提供该数据集的使用方法、下载方式、数据处理流程、分析软件要求或配套文档说明。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估、数据完整性说明、缺失值情况、批次效应或技术重复等信息。由于缺乏样本规模与实验设计细节,使用时应以源站原始记录为准,不宜对数据覆盖范围作额外推断。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用限制说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000078746

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

iTRAQ labelled depleted serum, SCX fractionated, RP-LC Orbitrap-Velos

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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