三种胰岛炎、β细胞应激与1型糖尿病发展模型的脂质组学

该数据集来自 omicsdi.org,属于内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类,主题标签为 Proteomics。数据覆盖三种胰岛炎与 1 型糖尿病进展模型:经促炎细胞因子 IL-1beta 和 IFN-gamma 处理的人胰岛与 EndoC-betaH1 β细胞,以及糖尿病发病前分离的非肥胖糖尿

omicsdi
浏览 9
时间序列分类Proteomics
Lipidomics of 3 models of insulitis, beta-cell stress and type 1 diabetes development

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

三种胰岛炎、β细胞应激与1型糖尿病发展模型的脂质组学

该数据集聚焦于胰岛炎、β细胞应激与1型糖尿病进展过程中的脂质组学变化,来源于omicsdi.org,归类于内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病方向,主题标签为Proteomics。数据集覆盖三种与胰岛炎和1型糖尿病进展相关的模型:经促炎细胞因子IL-1beta和IFN-gamma处理的人胰岛、经同样细胞因子处理的EndoC-betaH1 β细胞,以及糖尿病发病前分离的非肥胖糖尿病(NOD)小鼠胰岛。样本经氯仿:甲醇:水溶液提取后,采用LC-MS/MS进行分析,脂质鉴定使用LIQUID完成,定量则通过MZmine实现。整体而言,该数据集为研究炎症应激与1型糖尿病发展中的脂质代谢改变提供了组学层面的资源。

【数据集背景】

1型糖尿病是一种自身免疫相关疾病,胰岛炎和β细胞应激在其发生发展中具有重要地位。脂质不仅是细胞膜的结构组分,也参与信号转导、炎症调控和代谢稳态维持。在促炎细胞因子暴露或糖尿病发病前的病理阶段,脂质组成和丰度可能发生改变,进而影响β细胞功能与存活。该数据集围绕三种模型展开,旨在从脂质组学角度刻画胰岛炎、β细胞应激以及1型糖尿病进展过程中的分子特征。其分类归属于内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病,主题标签为Proteomics,来源站为omicsdi.org。

【数据内容】

数据集英文名称为“Lipidomics of 3 models of insulitis, beta-cell stress and type 1 diabetes development”。数据覆盖三类模型:第一,经促炎细胞因子IL-1beta和IFN-gamma处理的人胰岛;第二,经促炎细胞因子IL-1beta和IFN-gamma处理的EndoC-betaH1 β细胞;第三,糖尿病发病前分离的非肥胖糖尿病(NOD)小鼠胰岛。样本经氯仿:甲醇:水溶液提取,并通过LC-MS/MS进行分析。脂质鉴定采用LIQUID,定量采用MZmine。上述内容构成了该数据集在样本类型、处理条件和分析流程方面的核心信息。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。样本包括人胰岛、EndoC-betaH1 β细胞以及NOD小鼠胰岛。人胰岛和EndoC-betaH1 β细胞均接受IL-1beta和IFN-gamma处理,以模拟促炎细胞因子相关的胰岛炎和β细胞应激环境;NOD小鼠胰岛则在糖尿病发病前分离,用于反映1型糖尿病进展早期的状态。样本提取使用氯仿:甲醇:水溶液,随后进行LC-MS/MS分析。脂质鉴定和定量分别借助LIQUID与MZmine完成。除上述信息外,源站未提供更多关于样本数量、供体信息、动物周龄、具体试剂来源或仪器型号的细节。

【适用场景】

该数据集适用于脂质组学与糖尿病相关研究,尤其是围绕胰岛炎、β细胞应激和1型糖尿病进展的机制探索。研究人员可利用该数据比较促炎细胞因子处理前后人胰岛或EndoC-betaH1 β细胞的脂质变化,也可分析NOD小鼠在糖尿病发病前的胰岛脂质特征。其主题标签为Proteomics,但数据本身为脂质组学分析,因而适合与蛋白质组学、代谢组学或转录组学数据整合,用于探讨炎症、脂质代谢与β细胞命运之间的关系。此外,该数据集也可用于方法学参考,例如LC-MS/MS脂质分析、LIQUID鉴定和MZmine定量流程的实践示例。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据样本分组进行差异脂质分析:一组为经IL-1beta和IFN-gamma处理的人胰岛,一组为经相同细胞因子处理的EndoC-betaH1 β细胞,另一组为糖尿病发病前分离的NOD小鼠胰岛。由于脂质鉴定使用LIQUID、定量使用MZmine,用户在处理原始数据或结果表时,应关注脂质命名、定量峰面积或强度等信息。若需跨模型比较,应注意人胰岛、β细胞系与小鼠胰岛之间的物种和组织差异。源站未提供具体的数据下载格式、文件结构、预处理参数或统计方法,使用前需参考源站说明。

【质量与限制】

该数据集基于LC-MS/MS、LIQUID和MZmine等成熟流程,覆盖三种与胰岛炎和1型糖尿病进展相关的模型,具有明确的生物学背景。然而,源站未提供样本量、重复数、质控标准、缺失值处理、归一化方法或统计显著性阈值等信息,因此无法评估其统计功效和可重复性。此外,源站未提供脂质种类数量、鉴定置信度、定量线性范围或批次效应控制等细节。使用者在解释结果时应考虑这些限制,并结合源站提供的原始记录进行判断。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息。用户在使用或再分发数据前,应访问omicsdi.org对应页面,查阅源站发布的具体引用要求与许可声明。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000086174

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

三种胰岛炎和1型糖尿病进展模型的脂质组学分析:经促炎细胞因子IL-1beta和IFN-gamma处理的分离人胰岛和EndoC-betaH1 beta细胞,以及在糖尿病发病前分离的非肥胖糖尿病(NOD)小鼠的胰岛。样品用氯仿:甲醇:水溶液提取,并通过LC-MS/MS进行分析。脂质通过LIQUID进行鉴定,并使用MZmine进行定量。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案