APMAP在妊娠期糖尿病网膜脂肪组织中新功能的蛋白质组学鉴定

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000080798

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

妊娠期糖尿病（GDM）被认为是2型糖尿病的早期阶段。在本研究中，我们比较了六例GDM和六例NGT（健康对照）的人口统计学和临床数据，发现GDM中HOMA-IR升高。此前，许多研究已证明大网膜脂肪组织功能障碍可诱导胰岛素抵抗。因此，为了探究GDM中胰岛素抵抗的原因，我们采用非标记蛋白质组学技术发现GDM与NGT之间大网膜脂肪组织中差异表达的蛋白质。共鉴定出3529种蛋白质，其中包括66种显著变化的蛋白质。脂肪细胞质膜相关蛋白（APMAP，也称为C20orf3）是变化的蛋白质之一，在GDM大网膜脂肪组织中表达下调。进一步，我们使用成熟的3T3-L1脂肪细胞模拟大网膜脂肪细胞，发现通过RNAi抑制APMAP表达会损害脂肪细胞中的胰岛素信号传导并激活NFkB信号通路。这些结果表明，大网膜脂肪组织中APMAP的减少可能在GDM胰岛素抵抗过程中起重要作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。