通过转录组学识别糖尿病肾病生物标志物

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05378282

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：2型糖尿病、伴肾脏表现的2型糖尿病。2型糖尿病（T2D）被定义为一组以慢性高血糖为特征的代谢性疾病，由胰岛素分泌缺陷、胰岛素作用缺陷或两者共同导致。根据2012年全国健康调查，在墨西哥，大约每10人中就有1人患有T2D，但需要指出的是，这些数据仅反映了既往已确诊该病的受试者，而若将新诊断的T2D患者纳入，预计这一数字将增加一倍。此外，T2D在较年轻年龄组中的患病率有所上升（墨西哥25%的糖尿病病例发生在<43岁的年轻成人中），这意味着患者将带病生存>20年。因此，T2D位居主要死因之列，构成了该国的健康负担。据估计，超过40%的糖尿病患者将发生慢性肾脏病（CKD），约占所有开始肾脏替代治疗患者的40%。

在墨西哥社会保障研究所，肾病是该地区综合医院及高专科医院中五大就医原因之一。恰帕斯州图斯特拉-古铁雷斯的一项研究显示，糖尿病患者中肾病发病率为35%。Cueto-Manzano等人报告，在哈利斯科州756名糖尿病患者中，早期肾病发病率为40%，确立期肾病为29%。墨西哥另一项纳入瓜纳华托州3，609名糖尿病患者的研究报告，糖尿病肾病发病率为23.8%。最近在墨西哥州开展的一项研究纳入了44，458名确诊为T2D的受试者，记录到糖尿病肾病的发生率为9.1%。如果糖尿病病程不足十年，糖尿病肾病并不常见。最高的发病率平均为每年3%，多见于糖尿病发病后10至20年，此后肾病发病率逐渐下降。需要指出的是，糖尿病病程达20至25年而无临床

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。