巴氏灭活嗜黏蛋白阿克曼菌11对糖尿病小鼠肠道微生物组、短链脂肪酸及转录组的影响

该数据集包含支持巴氏灭活Akkermansia muciniphila 11 (pAKK11)治疗糖尿病小鼠模型研究结论的处理后数据,涵盖肠道菌群相对丰度(门和属水平)、短链脂肪酸(SCFA)定量、转录组分析(GSVA和差异表达基因),以及酶联免疫吸附试验(ELISA)、western blot和免

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2026-09-24 更新
浏览 3
基因组分类Akkermansia muciniphilashort-chain fatty acidsbutyrategut microbiomeRNA-seqdiabetes
Gut microbiome, SCFA and transcriptomic analyses of pasteurized <i>Akkermansia muciniphila</i> 11 (pAKK11) in diabetic mice

基本信息

模态
基因组
大小
0.017781686 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-09-24
版本
v1

资源简介

巴氏灭活嗜黏蛋白阿克曼菌11对糖尿病小鼠肠道微生物组、短链脂肪酸及转录组的影响

Gut microbiome, SCFA and transcriptomic analyses of pasteurized Akkermansia muciniphila 11 (pAKK11) in diabetic mice

该数据集包含支持巴氏灭活Akkermansia muciniphila 11 (pAKK11)治疗糖尿病小鼠模型研究结论的处理后数据,涵盖肠道菌群相对丰度(门和属水平)、短链脂肪酸(SCFA)定量、转录组分析(GSVA和差异表达基因),以及酶联免疫吸附试验(ELISA)、western blot和免疫荧光定量等蛋白水平测量结果。原始宏基因组测序数据存放于NCBI SRA的BioProject PRJNA1533690。共10个文件,可用于探索pAKK11对糖尿病小鼠肠道菌群、代谢物和转录组的影响(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026-09-24。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含支持巴氏灭活Akkermansia muciniphila 11 (pAKK11)治疗糖尿病小鼠模型研究结论的处理后数据。它包括:肠道菌群相对丰度(门和属水平)、短链脂肪酸(SCFA)定量、转录组分析(GSVA和差异表达基因),以及蛋白水平测量,包括酶联免疫吸附试验(ELISA)、western blot和免疫荧光定量。原始宏基因组测序数据可在NCBI SRA的BioProject PRJNA1533690下获取。

【数据结构与技术规格】

文件数 10 个,合计 17.78 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.33980176.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Industrial microbiology (incl. biofeedstocks)。主题标签:Akkermansia muciniphila、short-chain fatty acids、butyrate、gut microbiome、RNA-seq、diabetes。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Industrial microbiology (incl. biofeedstocks)。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Gut_microbiome_SCFA_and_transcriptomic_analyses_of_pasteurized_i_Akkermansia_muciniphila_i_11_pAKK11_in_diabetic_mice/33980176

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Wang, jiajia (2026). Gut microbiome, SCFA and transcriptomic analyses of pasteurized Akkermansia muciniphila 11 (pAKK11) in diabetic mice. figshare. Dataset

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源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.33980176

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 17.8 MB。

数据说明

该数据集包含经处理的数据,支持随附手稿中关于巴氏灭活嗜黏蛋白阿克曼菌11(pAKK11)治疗糖尿病小鼠模型的研究发现。数据集包括:肠道微生物组相对丰度(门和属水平)、短链脂肪酸(SCFA)定量、转录组分析(GSVA和差异表达基因),以及蛋白质水平测量,包括酶联免疫吸附测定(ELISA)、蛋白质印迹和免疫荧光定量。原始宏基因组测序数据可在NCBI SRA的BioProject PRJNA1533690中获取。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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