控制与慢性肾病患者皮下白色脂肪组织基因表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE98603

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

许多代谢紊乱，如蛋白质-能量消耗、胰岛素抵抗和血脂异常，是慢性肾脏病（CKD）的常见特征。然而，迄今为止，这些紊乱的潜在机制仍不明确。许多体外研究表明，白色脂肪细胞在模拟尿毒症环境的条件下表现出功能障碍。与此一致，一些动物实验报道慢性肾脏病与脂肪萎缩、脂肪组织功能障碍和异位脂质再分布相关。本方案的目标是收集并研究CKD V期患者白色脂肪组织的结构和代谢特性，以证实与CKD相关的脂肪组织功能障碍。主要结局指标是研究脂肪组织的细胞构成（即脂肪细胞大小），次要指标是使用微阵列研究基因表达谱以及脂肪组织的代谢特性（即脂肪生成）。

为此，将在法国里昂大学医院肾内科或泌尿外科招募11名成年男性志愿者和10名年龄、性别及体重指数（BMI）相匹配的非糖尿病、非透析的CKD V期患者。腹部皮下白色脂肪组织活检（2-3克）在择期泌尿外科手术期间进行（即CKD患者进行腹膜透析置管术，非CKD患者进行根治性前列腺切除术）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。