人类内脏脂肪组织跨代谢疾病状态单核与批量转录组图谱揭示THBS1为纤维炎症驱动因子

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE342773

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脂肪组织的细胞复杂性在代谢性疾病的发病机制中起着关键作用；然而，脂肪功能障碍的机制仍知之甚少。在此，我们构建了来自一个种族同质、代谢状态明确的队列（糖耐量正常的瘦者、肥胖者以及肥胖合并2型糖尿病患者）的人内脏脂肪组织的单核和批量转录组图谱。单核RNA测序（snRNA-seq）揭示了一个以THBS1高表达为特征的脂肪干细胞和脂肪细胞的纤维炎症亚群，与瘦对照组相比，该亚群在肥胖个体及肥胖合并2型糖尿病个体中富集。通过互补的体外、离体和体内实验，我们证明THBS1通过巨噬细胞介导的TGFbeta激活促进脂肪纤维化和炎症，损害脂肪生成和脂肪细胞功能。抑制THBS1可减轻代谢功能障碍脂肪组织中的纤维炎症特征。

总体而言，该数据集提供了跨越不同代谢疾病状态的人内脏脂肪组织的细胞图谱，并确定THBS1为关键的致病驱动因素和潜在的治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。