人内皮细胞转录组分析揭示糖尿病内皮功能障碍相关基因

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE341403

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

内皮功能障碍是糖尿病中最早发生的过程之一，也是驱动糖尿病并发症的关键机制。为了解内皮如何应对糖尿病损伤，我们对来自非糖尿病、糖尿病前期和2型糖尿病状态的去标识人类供体肠系膜动脉内膜进行了转录组分析。将差异表达基因与五种不同器官型内皮细胞（EC）在模拟糖尿病刺激（高糖和TNFα）处理后的基因表达进行了比较。该数据集提供了一个资源，涵盖从供体动脉新鲜收集的内膜以及接受糖尿病刺激的原代EC培养物的基因表达谱，使得能够进行体内-体外比较以及血管床特异性EC亚型比较。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。