骨髓来源Cxcr5+ B细胞介导肾损伤:早期糖尿病肾病的新型免疫治疗靶点
该数据集来自NCBI GEO,包含16周龄db/m与db/db小鼠骨髓和肾脏的单细胞RNA测序数据,结合多组学分析与抗CD20抗体介导的B细胞清除实验,用于刻画早期糖尿病肾病中B细胞状态变化

基本信息
资源简介
骨髓来源Cxcr5+ B细胞介导肾损伤:早期糖尿病肾病的新型免疫治疗靶点
Bone marrow-derived Cxcr5+ B cells mediate renal injury: a novel immunotherapeutic target for early-stage diabetic kidney disease
该数据集来自NCBI GEO,包含16周龄db/m与db/db小鼠骨髓和肾脏的单细胞RNA测序数据,结合多组学分析与抗CD20抗体介导的B细胞清除实验,用于刻画早期糖尿病肾病中B细胞状态变化。数据覆盖骨髓与肾脏组织,可支持B细胞分化异常、活化Cxcr5⁺ B细胞比例升高及Cxcl13/Cxcr5信号通路上调等免疫机制研究,并可用于探索早期糖尿病肾病的免疫治疗靶点(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 08 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):糖尿病肾病(DKD)是终末期肾病的主要原因,但导致早期肾损伤的免疫机制仍不完全清楚。本研究探讨早期DKD中B细胞动态与肾损伤之间的关联。我们对16周龄db/m和db/db小鼠的骨髓(BM)和肾脏进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq),并结合多组学数据分析以及抗CD20抗体介导的B细胞清除实验,以刻画早期DKD背景下B细胞的状态变化。我们观察到DKD小鼠骨髓中存在异常的B细胞分化,与对照组相比活化Cxcr5⁺ B细胞比例显著增加。Cxcl13/Cxcr5信号通路在DKD肾脏中明显上调,Cxcl13表达升高特异性定位于髓袢升支粗段(
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE338039
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 30 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
糖尿病肾病(DKD)是终末期肾病的主要原因,然而参与早期肾损伤的免疫机制仍未被完全阐明。本研究探讨早期DKD中B细胞动态与肾损伤之间的关联。我们对16周龄db/m和db/db小鼠的骨髓(BM)和肾脏进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq),并结合多组学数据分析以及抗CD20抗体介导的B细胞清除实验,以刻画早期DKD背景下B细胞状态的变化。我们观察到DKD小鼠骨髓中存在异常的B细胞分化,活化Cxcr5⁺ B细胞比例较对照组显著增加。Cxcl13/Cxcr5信号通路在DKD肾脏中明显上调,Cxcl13表达升高特异性定位于髓袢升支粗段(tAL)。细胞间通讯分析显示,tAL与B细胞之间的相互作用主要通过该轴显著连接。对小鼠和人B细胞中CXCR5的计算扰动分析突显了其与活化和分化特征的潜在关联。
此外,抗CD20介导的B细胞清除显著减轻了DKD小鼠的肾损伤,转录组分析提示这一保护效应伴随肾脏代谢通路的恢复。总体而言,我们的研究结果表明,骨髓Cxcr5⁺ B细胞的扩增与早期DKD肾损伤密切相关,CXCL13/CXCR5轴被确定为B细胞积聚的潜在介质。B细胞清除可改善肾损伤,提示B细胞的免疫调节可能是一种有前景的治疗途径,尽管直接因果验证仍需进一步的实验研究。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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