GSE337861:肾小管NAT10促进TGF-β和乳酸分泌驱动糖尿病肾病中成纤维细胞活化
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE337861_series_matrix.txt.gz),对应小鼠GPL24247平台,主题为糖尿病肾病中肾小管NAT10通过ac4C依赖方式稳定BRD4和PFKM mRNA,激活STAT3/TGF-β信号与乳酸-H3K18乳酸化轴,促进成纤维细胞活

基本信息
资源简介
GSE337861:肾小管NAT10促进TGF-β和乳酸分泌驱动糖尿病肾病中成纤维细胞活化
Tubular NAT10 promotes the secretion of TGF-β and lactate to drive the fibroblasts cells activation in diabetic kidney disease
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE337861_series_matrix.txt.gz),对应小鼠GPL24247平台,主题为糖尿病肾病中肾小管NAT10通过ac4C依赖方式稳定BRD4和PFKM mRNA,激活STAT3/TGF-β信号与乳酸-H3K18乳酸化轴,促进成纤维细胞活化和肾小管间质纤维化。数据可用于研究NAT10介导的肾小管损伤-纤维化信号机制及糖尿病肾病纤维化干预靶点(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 07 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):在糖尿病肾病(DKD)中,肾小管间质纤维化是进行性肾功能不全的主要决定因素,但驱动纤维化的肾小管机制仍不完全明确。在此,我们确定RNA乙酰转移酶NAT10是DKD中肾小管损伤至纤维化信号的关键介质。NAT10表达在高糖暴露的肾小管上皮细胞、糖尿病小鼠肾脏以及DKD患者肾活检标本中上调,部分通过NF-κB激活实现。机制上,NAT10促进BRD4和PFKM mRNA的ac4C依赖性稳定,从而激活STAT3/TGF-β信号和乳酸-H3K18乳酸化轴。这些通路协同促进成纤维细胞活化和促纤维化肾小管间质串扰。在体内,肾小管特异性敲除Nat10抑制了这些下游程序并减轻了肾脏纤维化。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Other、GPL24247、10090。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE337861
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 07 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE337861
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在糖尿病肾病(DKD)中,肾小管间质纤维化是进行性肾功能不全的主要决定因素,然而驱动纤维化的肾小管机制仍未被完全阐明。在此,我们确定RNA乙酰转移酶NAT10是DKD中肾小管损伤向纤维化信号转导的关键介质。NAT10的表达在高糖暴露的肾小管上皮细胞、糖尿病小鼠肾脏以及DKD患者的肾活检标本中上调,部分通过NF-κB激活实现。在机制上,NAT10促进BRD4和PFKM mRNA的ac4C依赖性稳定,从而激活STAT3/TGF-β信号通路和乳酸-H3K18乳酰化轴。这些通路协同促进成纤维细胞活化和促纤维化肾小管间质串扰。在体内,肾小管特异性敲除Nat10可抑制这些下游程序并减轻糖尿病小鼠的肾纤维化。用鸟苷二磷酸二钠盐对NAT10进行遗传和药理学抑制,同样改善了db/db小鼠的肾损伤和纤维化。
总之,这些发现表明NAT10是DKD相关纤维化的肾小管驱动因子,并支持将NAT10抑制作为DKD的潜在治疗策略。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




