小鼠结扎诱导牙周炎可能加速CD4+ T细胞衰老并加重类风湿关节炎
该数据集来自 NCBI GEO,研究小鼠结扎诱导牙周炎(LIP)对 CD4+ T 细胞衰老的影响及其与类风湿关节炎(RA)的关联

基本信息
资源简介
小鼠结扎诱导牙周炎可能加速CD4+ T细胞衰老并加重类风湿关节炎
Ligature-induced periodontitis in mice potentially accelerates CD4+ T cells senescence and exacerbates rheumatoid arthritis
该数据集来自 NCBI GEO,研究小鼠结扎诱导牙周炎(LIP)对 CD4+ T 细胞衰老的影响及其与类风湿关节炎(RA)的关联。数据覆盖 5、10、18、26、34、42 周龄 Balb/c 小鼠,采用高通量测序进行表达谱分析,包含 1 个文件 GSE318778_series_matrix.txt.gz。可用于探索牙周炎、免疫衰老、2 型糖尿病与 RA 之间的分子机制,以及衰老相关分泌表型(SASP)细胞因子和 PD-1/CD153 表达变化(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 09 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:慢性牙周炎通常影响 40–50 岁个体。衰老会损害免疫、维持慢性炎症并增强自身免疫,这一过程称为“免疫衰老”,它促进 2 型糖尿病和类风湿关节炎(RA)的发展。青春期后胸腺退化减少初始 T 细胞,促进衰老 CD4+ T 细胞。原因是衰老 T 细胞试图通过增殖到极限来补充这种减少,通过“稳态增殖”维持其绝对数量。这些细胞以 PD-1/CD153 表达为特征,表现出增殖减少和衰老相关分泌表型(SASP)细胞因子增加。本研究探讨小鼠结扎诱导牙周炎(LIP)如何影响 CD4+ T 细胞衰老。材料与方法:5、10、18、26、34 和 42 周龄 Balb/c 小鼠接受 LIP,通过 sil
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL34871、10090。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318778
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 16 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
目的:慢性牙周炎通常影响40-50岁人群。衰老会损害免疫、维持慢性炎症并增强自身免疫,这一过程称为“免疫衰老”,它促进2型糖尿病和类风湿关节炎(RA)的发展。青春期后胸腺退化减少初始T细胞,促进衰老CD4+ T细胞产生。原因是衰老T细胞试图通过增殖至极限来补充这一减少,通过“稳态增殖”维持其绝对数量。这些细胞以PD-1/CD153表达为特征,表现出增殖减少和衰老相关分泌表型(SASP)细胞因子增加。本研究探讨小鼠结扎诱导牙周炎(LIP)如何影响CD4+ T细胞衰老。材料与方法:5、10、18、26、34和42周龄的Balb/c小鼠通过上颌第二磨牙丝线结扎接受LIP。提取脾CD4+ T细胞,并与IL-2、抗TCRβ和抗CD28培养1至3天以模拟稳态增殖。在体外刺激前后比较LIP组与对照组的衰老标志物。
进行RNA测序(RNA-seq)分析以鉴定差异表达基因。结果:在小鼠的任何年龄阶段,LIP组与对照组之间PD-1/CD153双阳性细胞均未观察到显著差异。然而,体外刺激后,LIP组显示出更高比例的PD-1/CD153双阳性细胞,在18周时达到峰值。LIP组中的SASP细胞因子(骨桥蛋白、IL-6)高于对照组。衰老相关β-半乳糖苷酶(SAβ-gal)阳性的CD4+ T细胞更为普遍,表明LIP组衰老加速。此外,LIP组中处于S期的细胞较少,提示细胞周期停滞。RNA-seq提示“炎症反应”、“T细胞分化”、“STAT蛋白磷酸化”以及“JAK-STAT
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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