正常血糖、糖尿病前期与2型糖尿病全血DNA基线及随访甲基化图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE311226

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

这项纵向研究分析了被归类为血糖正常、糖尿病前期或2型糖尿病（T2DM）的成年人的全血DNA甲基化谱。研究采用Oxford Nanopore PromethION长读长测序（无PCR连接法制备）在基线和六年随访时生成全基因组CpG甲基化数据。数据集包括原始纳米孔读长（可在SRA中获取）和经处理的甲基化输出结果，包括CpG位点差异甲基化、甲基化汇总、启动子/CpG岛注释、HOMER功能注释以及基因-通路映射。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。