GSE301598：人干细胞来源胰岛与原生胰岛细胞类型特异性缺氧反应差异

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE301598

标准获取流程：

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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数据说明

干细胞来源胰岛（SC-islet）治疗1型糖尿病的成功受到移植后缺氧微环境中移植物存活不良的限制。尽管已有研究探讨了SC-islet对慢性缺氧的响应，但尚未在急性缺氧阶段与原发性人胰岛进行直接比较。在此，我们对暴露于急性缺氧（1% O2）48小时的人SC-islet和原代胰岛进行了比较性单细胞转录组和功能分析。我们的分析揭示了两种不同的响应模式。原代胰岛表现出能量保守型响应，抑制β细胞身份基因（PDX1、MAFA）和促凋亡因子如DDIT3，同时转向代谢静息状态。相比之下，SC-islet的响应以谱系不稳定性、向糖酵解的显著代谢转变以及促凋亡通路的激活为特征。在功能上，这些转录组差异导致两种胰岛类型均丧失葡萄糖刺激的胰岛素分泌，但机制不同：原代胰岛中分泌受到抑制，而SC-islet中则表现为失调的、对葡萄糖无反应的胰岛素释放。

这些发现表明，SC胰岛在缺氧应激下尤为脆弱，表现出不稳定且可塑的表型。这一比较数据集为开发针对特定来源的治疗干预措施提供了资源，以克服缺氧障碍并提高细胞替代疗法的疗效。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。