RNA-seq分析揭示hnRNPF在糖尿病肾病中的抗炎作用
研究以30 mM甘露醇模拟高渗环境，对过表达hnRNP-F的人肾近端小管上皮HK-2细胞及空载体转染阴性对照进行RNA测序，分析差异表达基因和可变剪接事件，并与既往高糖条件下hnRNP-F调控的数据整合
基本信息
资源简介
RNA-seq分析揭示hnRNPF在糖尿病肾病中的抗炎作用
RNA-seq Analysis Reveals the Anti-inflammatory Role of hnRNPF in Diabetic kidney disease
该数据集来自NCBI GEO，包含1个文件GSE299230_series_matrix.txt.gz，为RNA-seq表达谱数据。研究以30 mM甘露醇模拟高渗环境，对过表达hnRNP-F的人肾近端小管上皮HK-2细胞及空载体转染阴性对照进行RNA测序，分析差异表达基因和可变剪接事件，并与既往高糖条件下hnRNP-F调控的数据整合。数据可用于探索hnRNP-F在糖尿病肾病高渗应激下的抗炎转录调控机制（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jun 06 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：本研究使用30 mM甘露醇模拟高渗环境。将人肾近端小管上皮（HK-2）细胞转染以过表达hnRNP-F，以空载体转染细胞作为阴性对照（NC）。进行RNA测序（RNA-seq）以分析转录组变化，从而全面分析高渗应激下hnRNP-F过表达诱导的差异表达基因（DEG）和可变剪接事件（ASE）的改变。这些数据与我们先前获得的数据集整合，该数据集分析了高糖条件下HK-2细胞中hnRNP-F驱动的DEG和ASE调控。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL20795、9606。本站分类：内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299230
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 13 202，引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究采用30 mM甘露醇模拟高渗环境。将人肾近端小管上皮（HK-2）细胞转染以过表达hnRNP-F，并以转染空载体的细胞作为阴性对照（NC）。通过RNA测序（RNA-seq）分析转录组变化，从而全面分析高渗应激下hnRNP-F过表达诱导的差异表达基因（DEGs）和可变剪接事件（ASEs）的改变。这些数据与我们先前获得的高糖条件下HK-2细胞中hnRNP-F驱动的DEG和ASE调控数据集进行了整合。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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