GSE278204：CircRNA介导的ceRNA调控网络：肥胖型2型糖尿病进展与治疗策略的转录组学见解

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE278204

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数据说明

为探究糖尿病的发病机制并识别新型生物标志物，我们采用高通量RNA测序技术，对肥胖糖尿病患者（O-T2DM）血清样本中的circRNA和mRNA表达谱进行了分析。结果显示，与对照组相比，O-T2DM组中有442个差异表达的circRNA（343个上调，99个下调）和2756个差异表达的mRNA（277个上调，2479个下调）存在显著差异表达。随后，通过WGCNA和富集分析探究了DEmRNA的生物学功能。通路分析表明，差异表达的mRNA富集于T细胞受体、细胞衰老、NK细胞介导的细胞毒性、IL-17、脂质与动脉粥样硬化、肌动蛋白细胞骨架等通路。结合理论预测与临床实验数据构建的circRNA-miRNA-mRNA调控网络揭示了hsa_circ_0060614和hsa-mir-4668-3p对MT2A基因的潜在调控作用。我们采用qRT-PCR技术在O-T2DM组和对照组血浆样本中验证了这三个基因的表达水平。

我们的结果为肥胖型2型糖尿病的进一步研究提供了丰富的转录组数据。我们获得的ceRNA调控网络可能对O-T2DM的诊断和治疗具有指导意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。