综合应激反应促进巨噬细胞炎症

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE278047

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在1型糖尿病（T1D）发病早期，巨噬细胞即浸润胰岛，引发胰岛炎症，并随后被适应性免疫系统识别。对来自糖尿病前期雌性非肥胖糖尿病（NOD）小鼠的公开单细胞RNA测序数据集的重新分析显示，进化上保守的细胞通路——整合应激反应（ISR）在T1D进展过程中于巨噬细胞中上调。ISR由环境和病理应激因素触发，通过协调基因表达的适应性变化来维持细胞功能和存活，并被确定为靶向干预的候选对象。在此基础上，进行了关于巨噬细胞极化和迁移的体外实验，以评估ISR调节所导致的变化。结果显示，抑制ISR降低了巨噬细胞向促炎状态极化的倾向，而不影响抗炎极化，并降低了促炎巨噬细胞的迁移能力。

对糖尿病前期雌性NOD小鼠给予ISRIB（一种药理学ISR抑制剂）的观察表明，胰岛内巨噬细胞数量减少，而巨噬细胞上的PD-L1表达增加。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。