GSE273763：转录分析揭示DKD中已确立损伤和疾病进展的分子特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE273763

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

糖尿病是发达国家肾衰竭的首要病因。尽管其重要性不言而喻，但驱动糖尿病肾病发病机制的分子事件仍未被完全阐明。在此，我们对迄今转录组分析规模最大的糖尿病肾病患者队列进行了肾脏转录组的全面探索。利用RNA-Seq对50例糖尿病肾脏活检样本和13例健康对照活检样本进行转录组分析，我们将肾脏转录组与基线临床及组织学参数以及随时间推移的肾功能丧失速率相关联。我们呈现了人糖尿病肾病的全局转录特征，并鉴定了该疾病的不同分子亚型。最后，我们观察到与闰细胞功能身份相关的基因表达与疾病进展较慢之间存在关联。综上所述，通过揭示支撑糖尿病肾病发病机制的分子事件，我们的结果将成为研究界的宝贵资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。