NOD小鼠β细胞中IRE1α与XBP1独特及共享基因调控网络组分的界定

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE271480

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数据说明

临床与临床前证据表明，β细胞内质网应激及未折叠蛋白反应（UPR）失调参与1型糖尿病（T1D）的发病机制。在应激适应过程中，IRE1α作为UPR的关键感受器，可表现出多效性作用。在非肥胖糖尿病（NOD）小鼠发生胰岛炎之前，于β细胞中敲除IRE1α（Ire1αβ-/-）可对T1D提供保护。然而，介导这一保护作用的具体下游效应分子仍不清楚。本研究表明，β细胞特异性敲除IRE1α的下游效应分子Xbp1可保护小鼠免于T1D。组织学和单细胞转录组分析表明，Xbp1β-/-小鼠在很大程度上表现出与Ire1αβ-/-小鼠相似的表型。对Ire1αβ-/-和Xbp1β-/-小鼠胰岛的比较单细胞转录组和基因调控网络分析，不仅在β细胞中、也在其他非胰岛β细胞中揭示了独特的转录网络、生物学过程和网络调控因子。我们的研究结果明确了β细胞IRE1α/XBP1通路的作用，并鉴定了该通路在NOD小鼠中此前未被认识的网络和调控节点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。