丁酸钠通过PP2A-TFEB轴改善糖尿病肾病肾小管脂质蓄积
该数据集来自NCBI GEO,包含1个高通量测序表达谱文件,围绕丁酸钠(NaB)在糖尿病肾病(DKD)中对肾小管异位脂质沉积的预防作用及机制展开

基本信息
资源简介
丁酸钠通过PP2A-TFEB轴改善糖尿病肾病肾小管脂质蓄积
Sodium Butyrate Ameliorates Renal Tubular Lipid Accumulation Through the PP2A-TFEB axis in Diabetic Nephropathy
该数据集来自NCBI GEO,包含1个高通量测序表达谱文件,围绕丁酸钠(NaB)在糖尿病肾病(DKD)中对肾小管异位脂质沉积的预防作用及机制展开。数据可用于分析DKD背景下脂代谢紊乱与脂噬受损相关的基因表达变化,探索PP2A-TFEB轴调控肾小管脂质蓄积的分子路径,为筛选恢复自噬流和脂噬的干预靶点提供转录组层面的数据支持(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 29 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:糖尿病肾病(DKD)是全球终末期肾病的首要病因,治疗选择有限。脂代谢失调导致DKD发生的复杂发病机制仍不清楚。脂噬是指细胞内脂滴的自噬性降解,在DKD中被发现受损,导致肾小管功能障碍和异位脂质沉积(ELD)。肾小管中的脂毒性(lipotoxity)与DKD的发病机制密切相关。因此,开发能够恢复肾小管自噬流和脂噬的有效且安全的药物对于潜在的预防性干预至关重要。目的:本研究旨在探讨丁酸钠(NaB)对DKD进展中ELD的预防作用并阐明其相关机制。方法:NaB的有益作用为
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE266108
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数据说明
背景:糖尿病肾病(DKD)是全球终末期肾病的首要病因,治疗选择有限。脂代谢紊乱导致DKD发生的复杂发病机制仍不清楚。脂自噬是指细胞内脂滴的自噬性降解,在DKD中被发现受损,导致肾小管功能障碍和异位脂质沉积(ELD)。肾小管中的脂毒性(lipotoxity)与DKD的发病机制密切相关。因此,开发能够恢复肾小管自噬流和脂自噬的有效且安全的药物,对于潜在的预防性干预至关重要。目的:本研究旨在探讨丁酸钠(NaB)对DKD进展中ELD的预防作用,并阐明其潜在机制。方法:在糖脂毒性(GLT)刺激的HK-2细胞以及链脲佐菌素(STZ)注射联合高脂饮食诱导的DKD模型小鼠中,研究了NaB的有益作用。
此外,我们成功在HK-2细胞中沉默了转录因子EB(TFEB),并通过逆行输尿管灌注AAV9-shTFEB在小鼠中建立了肾脏特异性沉默模型。我们通过……研究了HK-2细胞中RNA的表达谱。NaB的作用机制通过RNA测序(RNA-seq)、pull-down MS实验、SPR实验等得以证实。结果:我们的研究发现,DKD患者血清丁酸水平降低,且与尿蛋白排泄量和eGFR具有统计学相关性。丁酸钠(NaB)剂量依赖性地改善了HK-2细胞和DKD模型小鼠肾小管上皮细胞中的脂质沉积。这一效应可能归因于促进TFEB去磷酸化,因为NaB可直接与PPP2R1A相互作用以激活PP2A磷酸化活性。因此,NaB可能通过PP2A-TFEB通路在改善DKD肾脏脂质沉积中发挥作用。结论:NaB作为PP2A-
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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