血浆microRNA作为慢性肾病诊断与预后生物标志物的研究数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262414

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

MicroRNAs（miRs）有潜力作为慢性肾脏病（CKD）的诊断和预后生物标志物，并在疾病发病机制中具有重要功能。为识别新的miR生物标志物，我们进行了小RNA测序（sRNA-Seq），以检测与肾功能正常的个体相比，合并CKD的2型糖尿病（T2D）个体循环中定量发生改变的miRs。与肾功能正常的T2D患者相比，肾功能减退的T2D患者循环中miR-190a-5p丰度显著降低。为验证循环miR-190a-5p的丢失是否与肾功能减退相关，我们在一个未经选择的CKD患者队列中检测了miR-190a-5p，并确定失调的miR-190a-5p是否能预测肾脏结局。在无白蛋白尿或中度白蛋白尿（<300mg/mmol）的个体中，血清miR-190a-5p水平可预测CKD进展（达到终末期肾病或eGFR较基线下降>30%，独立于年龄、性别、基线eGFR、尿白蛋白排泄或血压（校正HR 0.80，95% CI：0.66-0.96，p=0.015））。

为确定miR-190a-5p的肾脏来源，我们利用了小鼠肾损伤模型的转录组数据以及人类肾脏的单核（sn）RNA-Seq数据，发现miR-190a-5p在近端小管（PT）中富集，但在损伤后下调。生物信息学分析提示ADAM10可能是miR-190a-5p的潜在靶点，我们在人PT细胞系中对此进行了验证。我们的分析表明，miR-190a-5p是肾小管细胞健康的生物标志物，低循环水平可能预测低或中度蛋白尿患者的CKD进展，且独立于现有危险因素。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。