母体糖尿病下小鼠心咽发育的单细胞图谱

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母体糖尿病下小鼠心咽发育的单细胞图谱

GSE198905 是一个来源于 NCBI GEO 的公开数据集，全称为“Single-cell profiling of mouse cardio-pharyngeal development under maternal diabetes mellitus”，中文可译为“母体糖尿病条件下小鼠心咽发育的单细胞图谱”。该数据集在站内被归入内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类，主题涉及高通量测序表达谱分析，物种指向小鼠（分类编号 10090），平台编号为 GPL21103。数据集由作者 Tomohiro、Nishino 提交，发布时间为 202 年 3 月 17 日，共包含 1 个文件，样例文件名为 GSE198905_series_matrix.txt.gz。整体而言，该数据集围绕母体糖尿病这一代谢异常背景，利用单细胞层面的表达谱技术，刻画小鼠心咽区域在发育过程中的转录特征，为研究糖尿病对胚胎发育的影响提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集聚焦于母体糖尿病与小鼠心咽发育之间的关系。母体糖尿病属于内分泌、营养和代谢疾病范畴，可能影响胚胎发育过程，而心咽区域涉及心脏与咽部相关结构的形成。数据集通过高通量测序进行表达谱分析，从单细胞分辨率观察这一发育过程在母体糖尿病条件下的变化。源站标题明确指向“mouse cardio-pharyngeal development under maternal diabetes mellitus”，说明其研究对象为小鼠，研究条件为母体糖尿病，研究内容为心咽发育的单细胞图谱。该数据集在 NCBI GEO 中作为 SuperSeries 存在，源站描述指出其由下方列出的 SubSeries 组成。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件，样例文件为 GSE198905_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩格式，属于表达谱数据矩阵文件。主题标签显示其属于“Expression profiling by high throughput sequencing”，即基于高通量测序的表达谱分析；平台编号为 GPL21103；物种编号为 10090，对应小鼠。数据集标题和源站标题均强调“single-cell profiling”，表明数据具有单细胞层面的表达信息。除上述文件与标签信息外，源站未提供更详细的样本数量、细胞数量、基因数量或分组信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI GEO，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。作者为 Tomohiro 和 Nishino，发布时间为 202 年 3 月 17 日。数据集在站内被分类为内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病。源站描述仅说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成，未提供具体采集地点、实验条件、测序平台详细参数或样本处理流程。平台编号 GPL21103 和物种编号 10090 可作为来源信息的一部分，用于标识数据所依托的芯片或测序平台以及物种背景。

【适用场景】

该数据集适用于与母体糖尿病、小鼠心咽发育、单细胞表达谱相关的研究场景。研究人员可利用其探索母体糖尿病条件下胚胎心咽发育的转录特征，也可将其用于高通量测序表达谱的二次分析、方法验证或与其他发育生物学数据集的比较。由于数据涉及内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类，也可用于代谢异常与发育过程交叉领域的研究。具体适用性需结合源站提供的 SubSeries 和样本信息进一步判断，源站未提供更详细的适用建议。

【使用方法】

使用该数据集时，可先下载数据文件 GSE198905_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，需按对应格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入。由于文件为表达谱矩阵形式，通常可用于读取样本与表达值之间的对应关系。源站未提供具体的读取代码、软件推荐或分析流程，使用者应根据自身分析环境选择合适工具，并在正式分析前检查数据完整性与字段一致性。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件，文件样例为 GSE198905_series_matrix.txt.gz。源站描述仅说明其为 SuperSeries 并由 SubSeries 组成，未提供质控指标、测序深度、细胞过滤标准、批次信息或重复性评估。发布时间为 202 年 3 月 17 日，可能存在日期记录不完整的情况。由于源站未提供详细的质量评估信息，使用者在分析前应自行检查数据质量。该数据集的限制还包括：源站未提供样本数量、分组设计、具体实验条件以及统计方法，因此无法从现有信息判断其覆盖范围和偏倚程度。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Tomohiro 和 Nishino，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，发布时间为 202 年 3 月 17 日。源站未提供具体的引用格式、许可协议或使用限制。使用者在引用或再利用该数据集时，应参考 NCBI GEO 的通用引用规范，并依据源站页面提供的许可信息进行合规使用。由于源站未提供明确的许可条款，建议在使用前查阅源站页面以确认相关要求。