GSE136353：单细胞测序揭示Klinefelter综合征表型与基因型的关系

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE136353

标准获取流程：

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

男性不育最常见的先天性疾患之一是Klinefelter综合征。由于其在临床和遗传表现上的高度异质性，KS中转录组与临床表型及相关共病之间的关系尚未完全阐明。我们在此报告了一例47 XXY核型的中国男性（KS）不育患者，并通过单细胞测序分析了该中国男性与核型正常的女性对照者外周血单个核细胞（PBMCs）基因表达模式的差异。我们共分析了24，439个细胞，并根据标记基因将其分为5种免疫细胞类型（包括B细胞、T细胞、巨噬细胞、树突状细胞和自然杀伤细胞）。利用无监督降维和聚类算法，我们识别出KS与两名对照者之间分子特征不同的细胞亚群。基因本体富集分析得出的条目与KS中已知的共病以及受影响的免疫系统、I型糖尿病相关。基于我们的数据，我们指向几个可能参与KS表型的候选基因。

总体而言，我们的分析在单细胞水平上展示了KS患者PBMCs细胞类型的全面图谱，这将有助于预防合并症并提高KS患者的生活质量。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。