靶向下一代测序确定TGF-β1在肾纤维化中调控功能的数据集 [RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE121700

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转化生长因子-β（TGF-β1）在慢性肾衰竭的进展中发挥重要的调控作用。此外，肾小球系膜细胞的损伤是糖尿病肾病进展的核心环节。本研究旨在探讨系膜细胞响应TGF-β1时mRNA、microRNA与表观遗传学之间的遗传关联。通过用TGF-β1处理系膜细胞3天，随后利用下一代测序（NGS）进行全基因组miRNA、RNA、MeDIP-seq和H3K27Me3表达谱分析，在不同分子水平上研究了TGF-β1对系膜细胞的调控作用。每个样本设计了3个重复样本。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。