BLUEPRINT 1型糖尿病不一致单卵双生子单核细胞、T细胞和B细胞DNA甲基化谱(亚硫酸氢盐测序数据)

该数据集来源于 omicsdi.org,属于内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病分类,主题标签为 Genomics。数据为 BLUEPRINT 项目产生的亚硫酸氢盐测序(Bisulfite-Seq)DNA 甲基化谱,覆盖 1 型糖尿病不一致单卵双生子的单核细胞、T 细胞和 B 细胞

omicsdi
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基因组分类Genomics
ena-DATASET-BLUEPRINT-13-09-2016-12:21:58:649-53 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

BLUEPRINT 1型糖尿病不一致单卵双生子单核细胞、T细胞和B细胞DNA甲基化谱(亚硫酸氢盐测序数据)

ena-DATASET-BLUEPRINT-13-09-2016-12:21:58:649-53 - samples 是一个以基因组学为主题的数据集,来源于 omicsdi.org,在分类上归属于内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病方向。该数据集的核心内容是 BLUEPRINT 项目产生的 DNA 甲基化谱,采用亚硫酸氢盐测序(Bisulfite-Seq)技术获得,样本覆盖单核细胞、T 细胞和 B 细胞三类免疫细胞,取材对象为 1 型糖尿病不一致的单卵双生子。整体而言,该数据集围绕免疫细胞表观遗传特征与 1 型糖尿病之间的关系展开,为研究同卵双生子在疾病表现不一致情况下的 DNA 甲基化差异提供了数据基础。

【数据集背景】

1 型糖尿病是一种与免疫系统密切相关的代谢性疾病,单卵双生子在遗传背景上高度一致,但部分双生子对在 1 型糖尿病的发病上表现不一致,这种不一致现象为探讨除遗传因素之外的表观遗传调控作用提供了独特的研究素材。DNA 甲基化是表观遗传修饰的重要形式之一,能够在基因组序列不变的前提下影响基因表达状态。BLUEPRINT 项目针对这一研究场景,对 1 型糖尿病不一致单卵双生子的免疫细胞开展了 DNA 甲基化谱的测定,本数据集即为该项目产生的样本层面数据集合,主题标签为 Genomics,归属于内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病分类。

【数据内容】

该数据集的内容为 DNA 甲基化谱,测定技术为亚硫酸氢盐测序(Bisulfite-Seq)。所覆盖的细胞类型包括单核细胞、T 细胞和 B 细胞三类,均属于免疫系统相关细胞。样本来源为 1 型糖尿病不一致的单卵双生子。数据集名称中包含“samples”字样,表明其组织层级为样本层面。关于具体的样本数量、测序深度、甲基化位点数目、数据文件格式与体积等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org,原始描述指向 BLUEPRINT 项目。BLUEPRINT 项目产出的这批数据聚焦于 1 型糖尿病不一致单卵双生子的单核细胞、T 细胞与 B 细胞的 DNA 甲基化谱,采用亚硫酸氢盐测序获取。关于样本采集的具体地点、时间跨度、伦理审批信息、测序平台型号及试剂方案等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其内容特征,该数据集可用于围绕 1 型糖尿病与 DNA 甲基化之间关系的研究,例如比较单卵双生子对中患病个体与未患病个体在单核细胞、T 细胞和 B 细胞中的甲基化谱差异,探讨免疫细胞表观遗传修饰与疾病状态之间的关联;也可用于表观遗传学方法学研究中作为亚硫酸氢盐测序数据的参考来源。关于该数据集在其他具体研究中的实际应用案例与结论,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以样本层面数据的形式提供,使用时应结合亚硫酸氢盐测序数据的常规处理流程进行甲基化水平的提取与分析。关于数据的具体下载方式、文件组织方式、配套分析工具、参考基因组版本及预处理步骤等信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 BLUEPRINT 项目的亚硫酸氢盐测序产生,样本类型明确为单核细胞、T 细胞和 B 细胞,研究对象限定为 1 型糖尿病不一致单卵双生子。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、样本量大小及潜在偏倚等具体信息,源站未提供。使用时应注意其研究对象与细胞类型的特定范围,不宜直接外推至其他人群或其他细胞类型。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、文献出处、许可协议及使用限制等信息,源站未提供。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002682

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

BLUEPRINT DNA methylation profiles of monocytes, T cells and B cells in type 1 diabetes-discordant monozygotic twins (Bisulfite-Seq data).

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