数据集:尿液补体蛋白质组与糖尿病肾病进展密切相关

该数据集来自 search.dataone.org,属于内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病分类,主题标签为医学、健康与生命科学

dataone
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蛋白质预测Medicine, Health and Life Sciences
Data for: Urinary Complement Proteome Strongly Linked to Diabetic Kidney Disease Progression

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
预测
许可
http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

数据集:尿液补体蛋白质组与糖尿病肾病进展密切相关

Data for: Urinary Complement Proteome Strongly Linked to Diabetic Kidney Disease Progression 是一个以糖尿病及其肾脏并发症为关注点的蛋白质组学数据集,英文名称直接点明其研究主题为尿液补体蛋白质组与糖尿病肾病进展之间的关联。该数据集在分类上归入内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病类别,主题标签为医学、健康与生命科学,来源于 search.dataone.org 平台。按照源站描述,该数据集提供的是去标识化的蛋白质组学数据,并与一项前瞻性肾脏结局相关联,采用知识共享 CC0 1.0 公共领域贡献许可发布,便于研究者在遵守许可条款的前提下自由使用。整体而言,该数据集面向糖尿病肾病这一糖尿病重要并发症的机制与标志物研究,具有明确的研究导向和开放共享属性。

【数据集背景】

糖尿病肾病是糖尿病常见的慢性微血管并发症之一,也是导致终末期肾病的重要原因。寻找能够反映疾病进展风险的生物标志物,对于早期识别高危患者、优化随访和干预策略具有重要意义。补体系统作为先天免疫的重要组成部分,其活化与肾脏炎症及组织损伤之间存在广泛联系,因此尿液补体蛋白质组被视为探索糖尿病肾病进展机制的潜在切入点。该数据集正是围绕这一研究方向组织,其英文名称表明数据用于支撑“尿液补体蛋白质组与糖尿病肾病进展密切相关”这一主题的研究。数据集所属分类为内分泌、营养和代谢疾病下的糖尿病,主题标签为医学、健康与生命科学,说明其服务对象主要是代谢性疾病与肾脏结局相关的基础和临床研究群体。

【数据内容】

根据源站描述,该数据集的内容为去标识化的蛋白质组学数据,并与一项前瞻性肾脏结局相关联。这意味着数据主体是蛋白质组学测量结果,且这些测量结果可以与随访观察到的肾脏结局信息建立联系,从而支持围绕疾病进展的分析。去标识化处理表明数据在发布前已移除可识别个人身份的信息,以降低隐私风险。关于具体的样本类型、蛋白质数量、测量平台、结局定义、随访时长以及变量字段等细节,源站未提供。数据集的主题标签为医学、健康与生命科学,进一步说明其内容属于生命科学和健康研究范畴。

【采集与来源】

该数据集来源于 search.dataone.org 平台,源站对其的描述为去标识化的蛋白质组学数据,并与前瞻性肾脏结局相关联。由此可知,数据的产生与一项前瞻性肾脏结局观察有关,但关于采集地点、采集时间、研究对象人群特征、样本收集与处理流程、蛋白质组学检测方法等具体信息,源站未提供。数据经去标识化后发布,符合开放数据共享的一般做法。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于与糖尿病肾病进展相关的蛋白质组学研究,尤其是围绕尿液补体蛋白质组与肾脏结局关联的分析。潜在用途包括:验证或拓展补体相关蛋白作为疾病进展标志物的研究;结合前瞻性肾脏结局开展风险关联分析;作为蛋白质组学数据资源用于方法学比较或结果复现。由于数据与前瞻性肾脏结局相关联,也可用于探索基线蛋白质组特征与后续肾脏结局之间的关系。需要说明的是,上述场景均围绕数据主题和源站描述展开,具体分析可行性取决于数据中实际包含的变量和测量内容,源站未提供相关细节。

【使用方法】

该数据集以开放许可方式发布,使用者可通过 search.dataone.org 平台获取。使用时应遵循 CC0 1.0 许可条款,并按照蛋白质组学数据的常规处理流程进行质量控制、归一化和统计分析。由于源站未提供数据格式、文件结构、变量说明和分析脚本等信息,具体的使用步骤和技术细节需以数据实际内容和平台说明为准,源站未提供进一步指导。

【质量与限制】

该数据集的主要特点是去标识化和与前瞻性肾脏结局相关联,这为其在隐私保护和结局导向分析方面提供了基础。然而,受限于现有信息,无法对数据质量作出具体评价。数据规模、样本量、缺失情况、测量精度、批次效应以及结局 ascertainment 的细节均未在源站描述中体现。此外,数据集聚焦于特定主题,其结论外推到其他人群或其他肾脏疾病时应保持谨慎。使用者应结合自身研究目的评估适用性,源站未提供质量评估报告或限制说明。

【引用与许可】

该数据集采用知识共享 CC0 1.0 公共领域贡献许可,许可地址为 http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0。在该许可下,使用者可在无需额外授权的情况下复制、修改和分发数据,但建议按照学术规范注明数据来源。关于推荐引用格式、作者信息、版本号和发布年份等,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3A54187e8d92e227b2d6b2a5711f816ac5153c785f268854bb8f8fe5f5d7dda8e3

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

De-identified proteomics data linked to a prospective kidney outcome.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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