D7_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D7_iTRAQ 是来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集,归入内分泌系统疾病/糖尿病分类。数据包含 D7_1 与 D7_2 两组 8 plex iTRAQ 分析,针对去 depleted 血清样本,采集的 SCX 组分经 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管 LC

基本信息
资源简介
D7_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D7_iTRAQ 是一个来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集,归入内分泌系统疾病/糖尿病分类。该数据集围绕血清样本的 iTRAQ 定量蛋白质组分析展开,包含 D7_1 与 D7_2 两组 8 plex iTRAQ 分析,分析对象为去 depleted 血清样本。采集的 SCX 组分通过 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管 LC 组合进行分析,并采用 HCD 碎裂方式,数据以 mgf 文件形式提供。该数据集以蛋白质组学为主题标签,适合关注血清蛋白质定量分析及糖尿病相关内分泌研究的人员了解和使用。
【数据集背景】
D7_iTRAQ 属于内分泌系统疾病/糖尿病分类下的蛋白质组学数据资源,来源站为 omicsdi.org。其主题标签为 Proteomics,表明该数据集的核心内容围绕蛋白质组学实验数据展开。数据集名称中的 iTRAQ 指向所使用的同位素标记相对和绝对定量技术,而 D7_1 与 D7_2 则对应两组独立的 8 plex iTRAQ 分析。该数据集面向血清样本的蛋白质组研究场景,与内分泌系统疾病尤其是糖尿病方向的数据分类相关联。
【数据内容】
该数据集包含 D7_1 和 D7_2 两组 8 plex iTRAQ 分析所产生的结果文件。源站描述明确指出,这些文件是采集的 SCX 组分经分析后得到的 mgf 文件。mgf 是一种常见的质谱数据格式,通常用于存储肽段碎片谱信息。数据对象为去 depleted 血清样本,即经过 depleted 处理后的血清样本。除上述内容外,源站未提供更详细的数据内容说明。
【采集与来源】
数据来源于 omicsdi.org。实验分析采用 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管 LC 组合进行,SCX 组分在该液质联用平台上完成分析,碎裂方式为 HCD。样本类型为去 depleted 血清样本,实验设计为 8 plex iTRAQ 标记分析,分为 D7_1 与 D7_2 两组。除这些采集与来源信息外,源站未提供更详细的样本处理、仪器参数或采集流程说明。
【适用场景】
基于其蛋白质组学主题与糖尿病相关分类,该数据集可用于血清蛋白质组定量分析相关的研究场景,例如对去 depleted 血清样本中蛋白质进行 iTRAQ 定量比较的方法学参考。其 mgf 文件形式也适合作为质谱数据再分析、肽段谱库构建或蛋白质鉴定流程的输入数据。由于涉及内分泌系统疾病/糖尿病分类,该数据也可能服务于相关疾病背景下的蛋白质组探索性分析。具体适用场景应以源站描述为准,源站未提供更多场景说明。
【使用方法】
使用者可获取 D7_1 与 D7_2 对应的 mgf 文件,将其作为质谱谱图数据用于后续蛋白质组学分析流程。由于数据来自 8 plex iTRAQ 分析并经 SCX 组分采集,使用时可结合 iTRAQ 定量分析的一般流程进行处理。源站未提供具体的软件参数、分析步骤或使用指南,相关细节需参考源站信息。
【质量与限制】
该数据集为去 depleted 血清样本的 8 plex iTRAQ 分析结果,以 mgf 文件形式提供,采集平台为 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管 LC 组合,碎裂方式为 HCD。源站未提供关于数据质量评估、覆盖度、重复性或其他质量指标的信息,也未说明数据的具体限制条件。使用者在分析时应结合自身需求评估数据适用性。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000078753
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
D7_1和D7_2是对去 depleted 血清样本进行的8重iTRAQ分析。这些文件是收集的SCX组分经Orbitrap Velos-Proxeon毛细管LC组合分析后得到的mgf文件。使用了HCD碎裂方式。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




