D4_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D4_iTRAQ 是来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集，归入内分泌系统疾病/糖尿病分类。该数据包含 D4_1 与 D4_2 两组 8 plex iTRAQ 分析，针对去 depleted 血清样本，文件为经 SCX 分级后以 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管
基本信息
资源简介
D4_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D4_iTRAQ 是一个来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集，归入内分泌系统疾病/糖尿病分类。该数据集围绕血清样本的 iTRAQ 定量蛋白质组分析展开，包含 D4_1 与 D4_2 两组 8 plex iTRAQ 分析，研究对象为去 depleted 血清样本。数据文件为经 SCX 分级收集后、使用 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管液相色谱联用系统分析所得的 mgf 文件，肽段碎裂采用 HCD 方式。该数据集以质谱原始谱图文件的形式提供，可供蛋白质组学研究者用于血清蛋白质的鉴定与定量相关分析。
【数据集背景】
该数据集属于内分泌系统疾病/糖尿病分类下的蛋白质组学研究资源，主题标签为 Proteomics。其设计指向血清样本的蛋白质组定量比较：通过 8 plex iTRAQ 标记结合去 depleted 血清样本处理，降低血清中高丰度蛋白对低丰度蛋白检测的干扰，从而提升对血清蛋白质组的覆盖与定量能力。数据集包含 D4_1 与 D4_2 两组独立的 8 plex iTRAQ 分析，构成同一研究框架下的两个分析批次或两个实验单元。
【数据内容】
数据内容为 mgf 格式的质谱谱图文件，来源于经 SCX（强阳离子交换）分级收集的肽段组分。每组分析对应 8 plex iTRAQ 标记体系，即在同一质谱分析中可对多达八个样本进行相对定量比较。文件本身为收集到的 SCX 分级组分经质谱分析后生成的谱图数据，可用于后续的肽段与蛋白质鉴定及 iTRAQ 报告离子定量。
【采集与来源】
数据来源于 omicsdi.org。样本类型为去 depleted 血清。分析平台为 Orbitrap Velos 质谱仪与 Proxeon 毛细管液相色谱的组合，采用 HCD 碎裂方式产生谱图。肽段在质谱分析前经过 SCX 分级，以降低样品复杂度。数据以 mgf 文件形式保存所收集的 SCX 分级组分的分析结果。
【适用场景】
该数据集适用于血清蛋白质组学的鉴定与定量研究，尤其是基于 iTRAQ 标记的相对定量分析场景；可用于评估去 depleted 血清样本在 8 plex iTRAQ 体系下的蛋白质检出与定量表现，也可作为质谱数据处理流程（如谱图文件解析、肽段鉴定、报告离子定量）的方法学测试数据。在内分泌系统疾病/糖尿病相关研究中，此类血清蛋白质组数据可用于探索候选蛋白标志物的分析流程验证。
【使用方法】
使用时可从 mgf 谱图文件出发，结合相应的蛋白质序列数据库进行肽段与蛋白质鉴定，并利用 iTRAQ 报告离子信息完成相对定量。由于数据经过 SCX 分级，分析时应按分级组分组织文件，并在鉴定与定量阶段考虑分级带来的组分合并问题。两组 8 plex 分析（D4_1 与 D4_2）可分别处理后再进行比较或整合。具体搜索参数、标记试剂批次与实验设计细节源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为去 depleted 血清样本的 iTRAQ 谱图数据，其覆盖范围受血清高丰度蛋白去除效果与 SCX 分级策略影响；mgf 文件为谱图层面的数据，不包含原始质谱文件。样本数量、生物学重复、定量准确性评估指标以及缺失值情况源站未提供。使用者在解释定量结果时需注意 iTRAQ 实验固有的比率压缩与批次效应等问题，但该数据集的具体质控结论源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式与许可信息源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000078751
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
D4_1和D4_2是对去 depleted 血清样本进行的8 plex iTRAQ分析。该文件包含收集的SCX组分经Orbitrap Velos-Proxeon毛细管LC组合分析所得的mgf文件。采用了HCD碎裂方式。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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