D3_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D3_iTRAQ 是来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集，归入内分泌系统疾病/糖尿病分类。该数据包含 D3_1 与 D3_2 两组 8 重 iTRAQ 分析，针对去 depleted 血清样本，以 mgf 文件形式提供经 SCX 分级后、用 Orbitrap Velos 与 Proxe
基本信息
资源简介
D3_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D3_iTRAQ 是一个来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集，归入内分泌系统疾病/糖尿病分类。该数据集围绕血清样本的定量蛋白质组分析展开，包含 D3_1 与 D3_2 两组 8 重 iTRAQ 分析，所用样本为去 depleted 血清样本。数据以 mgf 文件形式提供，这些文件对应经 SCX 分级收集、并采用 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管液相色谱组合进行分析的组分，肽段碎裂采用 HCD 方式。该数据集以蛋白质组学为主题标签，适合作为血清蛋白质定量分析相关研究的参考数据资源。
【数据集背景】
该数据集归入内分泌系统疾病/糖尿病分类，主题标签为蛋白质组学。从源站描述可知，其设计目标是针对血清样本开展基于 iTRAQ 的定量蛋白质组分析。血清是临床蛋白质组研究中常用的样本类型，而去 depleted 血清样本的处理方式表明分析前对高丰度蛋白进行了去除，以便提升中低丰度蛋白的检出能力。数据集名称中的 D3 对应 D3_1 与 D3_2 两组分析，iTRAQ 则指明其采用的同位素标记相对和绝对定量技术路线。
【数据内容】
数据集包含 D3_1 和 D3_2 两组 8 重 iTRAQ 分析。源站描述明确说明，这两组分析针对的是去 depleted 血清样本。数据以 mgf 文件形式提供，这些 mgf 文件对应经 SCX 分级收集的组分。8 重 iTRAQ 意味着每组分析可同时比较八个标记样本，但具体样本分组、标记方案与生物学重复设置，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。数据采集使用 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管液相色谱组合进行分析，肽段碎裂采用 HCD 方式。样本在质谱分析前经过 SCX 分级，收集的组分再进入液质联用分析，最终以 mgf 格式文件呈现。除上述仪器组合与碎裂方式外，关于采集时间、实验室地点及原始仪器参数文件等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于蛋白质组学中基于 iTRAQ 标记的血清定量分析相关用途，例如作为 mgf 谱图文件用于肽段与蛋白质鉴定、定量流程的测试或方法比较。由于其归入内分泌系统疾病/糖尿病分类，也可作为该疾病领域血清蛋白质组研究的参考数据。需要说明的是，源站描述未给出具体的疾病分组、临床信息或标志物结论，因此不应将本数据集直接视为某一临床结论的证据来源。
【使用方法】
使用者可获取以 mgf 文件形式提供的数据，这些文件对应经 SCX 分级收集的组分，可导入常规蛋白质组学搜索与定量软件进行处理。由于数据来自 8 重 iTRAQ 分析，分析时需考虑相应的标记试剂设置与报告离子定量策略。关于具体的文件命名规则、目录结构、推荐软件版本及参数配置，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为去 depleted 血清样本的 8 重 iTRAQ 分析，采用 SCX 分级与 Orbitrap Velos/Proxeon 毛细管液相色谱组合、HCD 碎裂方式采集。源站描述未提供鉴定深度、定量精度、缺失值比例等质量指标，也未说明样本量、重复次数与统计分析方法，因此其质量水平需使用者自行评估。此外，数据仅以 mgf 文件形式提供，是否包含原始谱图文件，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与使用许可，源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前，应前往 omicsdi.org 对应条目核实相关声明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000078750
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
D3_1和D3_2是对去 depleted 血清样本进行的8 plex iTRAQ分析。该文件代表收集的SCX组分经Orbitrap Velos-Proxeon毛细管LC组合分析后得到的mgf文件。使用了HCD碎裂方式。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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