D2_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D2_iTRAQ 是来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集，归入内分泌系统疾病/糖尿病分类。该数据包含 D2_1 与 D2_2 两组 8 plex iTRAQ 分析，针对去 depleted 血清样本，文件为经 SCX 分级后以 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管
基本信息
资源简介
D2_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D2_iTRAQ 是一个来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集，归入内分泌系统疾病/糖尿病分类。该数据集包含 D2_1 与 D2_2 两组 8 plex iTRAQ 分析，针对去 depleted 血清样本开展。数据文件为经 SCX 分级后、使用 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管液相色谱联用系统分析所收集组分的 mgf 文件，碎裂方式为 HCD。该数据集以蛋白质组学为主题标签，可为血清蛋白质组的定量研究提供原始质谱数据资源。
【数据集背景】
D2_iTRAQ 属于内分泌系统疾病/糖尿病分类下的蛋白质组学数据资源，来源于 omicsdi.org。其主题标签为 Proteomics。该数据集围绕血清样本的 iTRAQ 定量蛋白质组分析展开，采用 8 plex iTRAQ 标记策略，对去 depleted 血清样本进行分析，旨在通过质谱手段获取血清蛋白质组的定量信息。关于该数据集所依托的具体研究项目背景、实验设计目的及生物学假设，源站未提供。
【数据内容】
该数据集包含 D2_1 与 D2_2 两组 8 plex iTRAQ 分析。数据文件形式为 mgf 文件，对应经 SCX（强阳离子交换）分级后收集的各组分。这些 mgf 文件记录了上述组分在 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管液相色谱联用系统上分析所得的质谱数据。关于样本的具体数量、分组信息、iTRAQ 标记通道与样本的对应关系、鉴定到的蛋白质或肽段数目等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 omicsdi.org。样本类型为去 depleted 血清样本，即经过 depletion 处理去除了高丰度蛋白的血清。分析平台为 Orbitrap Velos 质谱仪与 Proxeon 毛细管液相色谱的组合，采用 HCD 碎裂方式。在质谱分析前，样本经过 SCX 分级，收集各分级组分后分别进行 LC-MS 分析，最终生成 mgf 格式的质谱数据文件。关于样本采集地点、时间、伦理审批及具体 depletion 方法等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于血清蛋白质组学的定量分析研究，尤其是基于 iTRAQ 标记的 8 plex 定量实验。由于样本为去 depleted 血清，可用于低丰度血清蛋白的鉴定与定量探索。结合其内分泌系统疾病/糖尿病的分类归属，该数据可用于相关疾病背景下血清蛋白质组特征的分析。此外，mgf 文件可直接用于蛋白质鉴定搜索引擎的输入，支持肽段与蛋白质的鉴定及后续定量分析。关于该数据集在具体疾病研究中的验证性应用，源站未提供。
【使用方法】
使用者可将 mgf 文件作为质谱数据输入，配合相应的蛋白质序列数据库与搜索算法进行肽段和蛋白质鉴定。由于数据来自 8 plex iTRAQ 实验，分析时需考虑 iTRAQ 报告离子的定量信息提取。对于 SCX 分级产生的多个组分文件，可按分级顺序分别搜索或合并分析。关于推荐的搜索参数、定量软件及具体分析流程，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 mgf 格式的质谱数据文件，来源于 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管 LC 联用系统，采用 HCD 碎裂。关于数据的质量评估指标、缺失值情况、重复性及批次效应等信息，源站未提供。使用时应注意到数据集仅包含 D2_1 与 D2_2 两组 8 plex 分析，样本规模有限，且去 depleted 血清处理可能影响部分高丰度蛋白的定量解释。关于数据的具体限制说明，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000078749
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
D2_1和D2_2是对去 depleted 血清样本进行的8 plex iTRAQ分析。该文件代表了收集的SCX组分经Orbitrap Velos-Proxeon毛细管LC组合分析所得的mgf文件。采用了HCD碎裂方式。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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