D16_LF 无标记血清蛋白质组学数据集

该数据集为来源站 omicsdi.org 收录的 D16_LF 无标记血清蛋白质组学分析数据,包含 Case2T 与 Control2T(CS 与 CO)两组样本,分别对应 D16 与 Control-16,并以访视编号标记

omicsdi
浏览 12
蛋白质分类Proteomics
D16_LF

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

D16_LF 无标记血清蛋白质组学数据集

D16_LF 是一个收录于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集,归类于内分泌系统疾病中的糖尿病方向。该数据集围绕无标记(label free)血清蛋白质组学分析展开,样本经耗竭处理后,采用 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管液相色谱联用系统进行检测,并以 CID 碎裂方式采集数据。数据集包含 Case2T 与 Control2T 两组样本,分别对应 D16 与 Control-16,样本以访视编号进行标记,每组样本均进行了四重复分析,且重复顺序经过随机化处理。该数据集的主题标签为 Proteomics,可为糖尿病相关的血清蛋白质组研究提供原始质谱数据资源。

【数据集背景】

该数据集属于内分泌系统疾病 / 糖尿病分类下的蛋白质组学数据。从来源站提供的描述可知,其研究场景涉及血清样本的蛋白质组学比较分析,设置了 D16 与 Control-16 两个组别,并以 Case2T 与 Control2T(CS 与 CO)标识对应的样本文件。数据集采用无标记定量策略,即不依赖同位素标记,直接对酶解肽段进行质谱分析,这类设计通常用于组间蛋白质丰度差异的探索性研究。关于该研究的具体科学假设、临床背景及样本来源的详细信息,源站未提供。

【数据内容】

数据集的核心内容为 Thermo RAW 格式的质谱原始文件,包括 Case2T 与 Control2T(CS 与 CO)两类文件,分别代表 D16 与 Control-16 样本,并通过访视编号加以标记。样本为经耗竭处理的血清,分析方式为无标记蛋白质组学。数据采集使用 Orbitrap Velos 质谱仪与 Proxeon 毛细管液相色谱组合,碎裂方式为 CID。每个样本进行了四重复分析,重复的进样顺序经过随机化,以降低系统偏差的影响。除上述 RAW 文件及样本分组信息外,源站未提供更多关于蛋白质鉴定数量、定量结果或注释文件的内容。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。实验采用 Orbitrap Velos- Proxeon 毛细管 LC 联用平台,对耗竭血清样本进行无标记分析,碎裂方式为 CID。样本包括 D16 组与 Control-16 组,分别以 Case2T 和 Control2T(CS 与 CO)命名,并以访视编号标记。所有样本均进行四重复分析,重复顺序随机化。关于样本采集地点、伦理审批及临床信息,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于血清蛋白质组学的无标记定量分析场景,可用于比较 D16 与 Control-16 两组样本之间的蛋白质组差异,也适合作为 LC-MS/MS 数据处理流程的方法学参考,例如肽段与蛋白质鉴定、无标记定量及重复性评估等。由于样本为耗竭血清,该数据也可用于血清低丰度蛋白富集策略相关的方法研究。关于其在糖尿病生物标志物发现等具体方向上的适用性,源站未提供明确说明。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据文件命名中的 Case2T、Control2T(CS、CO)及访视编号区分样本分组与个体来源,并结合四重复与随机化设计进行组内与组间比较。RAW 文件需经质谱数据处理软件完成峰提取、数据库搜索与定量分析。由于源站未提供具体的搜索参数、数据库版本及分析流程,使用者需自行确定处理方案。源站未提供数据下载方式与访问条件的具体说明。

【质量与限制】

该数据集采用四重复分析与随机化进样,有助于评估技术重复性并减少顺序效应。但源站未提供鉴定深度、定量精度、缺失值比例等质量指标,也未说明样本量、临床特征及是否设置其他对照。此外,数据仅为无标记血清蛋白质组分析,未提供翻译后修饰富集或绝对定量信息。使用者在解释组间差异时需考虑这些限制。源站未提供其他质量相关说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用文献、DOI、许可协议及使用条款信息。使用者在引用或再利用该数据前,应访问 omicsdi.org 上的对应条目以获取最新的引用与许可要求。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000078762

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Thermo RAW文件Case2T和Control2T(CS和CO)分别代表D16和Control-16,并以访视编号标记。这些是使用Orbitrap Velos-Proxeon毛细管LC组合对去 depleted 血清样本进行的非标记分析。采用了CID碎裂方式。样本以四重复进行分析,并进行了随机化处理。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案