D14_LF 糖尿病血清蛋白质组数据集
D14_LF 是来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集,归入内分泌系统疾病下的糖尿病分类。该数据可用于糖尿病相关血清蛋白表达差异的探索性分析(来源 omicsdi.org)

基本信息
资源简介
D14_LF 糖尿病血清蛋白质组数据集
D14_LF 是一个来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集,归入内分泌系统疾病下的糖尿病分类。该数据集围绕去 depleted 血清样本的无标记(label free)分析展开,涉及 Case19T 与 Control19T 两类样本,分别对应 D14 与 Control-14,并以访视编号进行标记。数据采集采用 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管液相色谱联用系统,碎裂方式为 CID。作为糖尿病相关蛋白质组学资源,D14_LF 可用于血清蛋白表达差异的探索性分析,为内分泌系统疾病尤其是糖尿病方向的研究提供质谱原始数据支持。
【数据集背景】
D14_LF 属于内分泌系统疾病 / 糖尿病分类下的蛋白质组学数据集,来源站为 omicsdi.org。糖尿病是一类以糖代谢紊乱为特征的常见内分泌代谢疾病,其发生发展涉及复杂的分子网络变化,血清作为易于获取的生物体液,常被用于寻找与疾病状态相关的蛋白标志物。该数据集以血清样本为分析对象,采用无标记定量策略,旨在从蛋白质层面刻画样本间的差异,为糖尿病相关机制研究与候选标志物筛选提供数据基础。主题标签为 Proteomics,表明其核心内容为蛋白质组学实验数据。
【数据内容】
该数据集包含以 RAW 文件形式记录的质谱原始数据,涉及 Case19T 与 Control19T 两类样本。根据源站描述,Case19T 与 Control19T 分别代表 D14 与 Control-14,并通过访视编号进行标记。样本类型为 depleted 血清样本,即经过高丰度蛋白去除处理的血清,以提升低丰度蛋白的检出能力。数据分析方式为无标记(label free)分析,不依赖同位素标记进行定量。除上述样本与文件信息外,源站未提供更详细的蛋白鉴定数量、定量结果表或差异蛋白列表等内容。
【采集与来源】
数据采集使用 Orbitrap Velos 质谱仪与 Proxeon 毛细管液相色谱联用系统,采用 CID(碰撞诱导解离)碎裂方式。样本为 depleted 血清,分析策略为无标记蛋白质组学。数据来源站为 omicsdi.org,该数据集在该站被归入内分泌系统疾病 / 糖尿病分类。除仪器配置、碎裂方式与样本处理策略外,源站未提供更详细的色谱梯度、质谱参数、样本采集时间与临床信息等内容。
【适用场景】
基于其血清蛋白质组学属性,D14_LF 可用于糖尿病相关血清蛋白表达差异的探索性分析,例如比较 Case19T 与 Control19T 所代表样本组之间的蛋白丰度变化,寻找潜在差异蛋白,或作为独立数据集对已有发现进行验证与补充。此外,该数据也可用于无标记血清蛋白质组学分析流程的方法学参考,包括 depleted 血清样本的质谱数据处理与差异分析策略。需要说明的是,上述用途为基于数据类型的通用应用方向,源站未提供该数据集的具体研究结论或应用案例。
【使用方法】
使用该数据集时,可围绕 RAW 文件开展后续处理,包括谱图格式转换、数据库搜索、蛋白鉴定与无标记定量分析,并结合 Case19T 与 Control19T 的访视编号标记进行样本分组比较。由于样本经过 depleted 血清处理,分析中宜考虑高丰度蛋白去除对定量结果的影响。具体分析流程、参数设置与统计方法源站未提供,使用者需依据自身研究目的设计分析方案。
【质量与限制】
该数据集为无标记分析,样本涉及 Case19T 与 Control19T 两组,并以访视编号标记,样本规模与分组细节源站未提供。源站未提供数据质量评估指标、缺失值情况、重复次数或技术验证信息。由于缺乏详细的临床背景与实验参数,数据解读需谨慎,差异分析结果应结合独立验证。源站未提供关于数据完整性或质控标准的具体说明。
【引用与许可】
该数据集来源于 omicsdi.org,引用方式与许可信息源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应查阅来源站的相关说明并遵循其使用条款。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000078760
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
RAW文件Case19T和Control19T分别代表D14和Control-14,并以访视编号标记。这些是使用Orbitrap Velos-Proxeon毛细管LC组合对去 depleted 血清样本进行的无标记分析。使用了CID碎裂。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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