D12_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D12_iTRAQ 是来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集，归入内分泌系统疾病/糖尿病分类。该数据包含 D12_1 与 D12_2 两组 8 重 iTRAQ 分析，针对去 depleted 血清样本，采集的 SCX 组分经 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管 LC
基本信息
资源简介
D12_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D12_iTRAQ 是一个蛋白质组学数据集，来源于 omicsdi.org，在分类上归入内分泌系统疾病 / 糖尿病方向。该数据集围绕血清样本的定量蛋白质组分析展开，包含 D12_1 与 D12_2 两组 8 重 iTRAQ 分析，所用样本为去 depleted 血清样本。数据文件为经 SCX 分级后采集组分的 mgf 文件，这些组分通过 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管 LC 联用系统进行分析，并采用 HCD 碎裂方式。整体而言，该数据集提供了以 iTRAQ 定量策略研究血清蛋白质组的原始质谱数据资源，可供蛋白质组学与相关疾病研究领域参考使用。
【数据集背景】
该数据集归属于内分泌系统疾病 / 糖尿病分类，主题标签为 Proteomics。从样本类型看，其分析对象为去 depleted 血清样本，这类样本处理方式通常用于降低血清中高丰度蛋白对低丰度蛋白检测的干扰，从而提升蛋白质组分析的覆盖深度。数据集采用 8 重 iTRAQ 标记策略，属于基于质谱的定量蛋白质组学范畴，适合在组间比较的框架下考察血清蛋白质的相对丰度变化。关于该数据集的具体研究背景、所涉及的生物学问题及实验设计细节，源站未提供。
【数据内容】
数据集包含 D12_1 与 D12_2 两组 8 重 iTRAQ 分析。数据文件形式为 mgf 文件，对应经 SCX 分级收集的组分。mgf 是质谱二级谱图的通用文本格式，通常用于承载肽段碎片离子信息，可导入多种蛋白质组学搜索软件进行后续解析。关于每组分析的具体样本数量、标记通道分配、组分数量、文件数量及文件大小等信息，源站未提供。
【采集与来源】
数据采集使用 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管 LC 联用系统，对 SCX 分级后的组分进行分析，碎裂方式为 HCD。数据来源站为 omicsdi.org。关于样本采集时间、地点、伦理审批及原始仪器参数等详细信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于基于 iTRAQ 标记的血清定量蛋白质组学数据分析流程的建立与验证，包括 mgf 文件的谱图解析、肽段与蛋白质鉴定、以及标记通道间的相对定量比较。其内分泌系统疾病 / 糖尿病分类提示该数据可能服务于相关疾病方向的蛋白质组研究，但具体应用结论需以原始研究为准。关于该数据集已验证的具体应用场景，源站未提供。
【使用方法】
使用时可从 omicsdi.org 获取 mgf 文件，将其导入支持 mgf 格式的蛋白质组学搜索软件，结合相应数据库完成肽段与蛋白质鉴定，并在 iTRAQ 标记通道层面进行定量分析。由于数据来自 SCX 分级组分，分析时宜按组分分别处理后再合并结果。关于推荐的搜索参数、数据库版本及定量归一化策略，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为去 depleted 血清样本的 iTRAQ 分析数据，血清样本本身的复杂度与去 depleted 处理的效果会影响低丰度蛋白的检出。数据以 mgf 谱图文件形式提供，不含原始仪器文件，可能限制对采集过程的深度复核。关于数据质量评估指标、缺失值情况及相关验证结果，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 omicsdi.org。关于数据集的引用方式、原始发表文献、许可协议及使用限制，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000078759
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
D12_1和D12_2是对去 depleted 血清样本进行的8 plex iTRAQ分析。这些文件是收集的SCX馏分的mgf文件，使用Orbitrap Velos-Proxeon毛细管LC组合进行分析。采用了HCD碎裂。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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