D11_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D11_iTRAQ 是来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集，归入内分泌系统疾病/糖尿病分类。数据包含 D11_2 与 D11_3 两组 8 plex iTRAQ 分析，针对去 depleted 血清样本，采集的 SCX 组分经 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管
基本信息
资源简介
D11_iTRAQ 糖尿病血清蛋白质组数据
D11_iTRAQ 是一个来源于 omicsdi.org 的蛋白质组学数据集，归入内分泌系统疾病/糖尿病分类。该数据集围绕血清样本的 iTRAQ 定量蛋白质组分析展开，包含 D11_2 与 D11_3 两组 8 plex iTRAQ 分析，所用样本为去 depleted 血清样本。采集到的 SCX 组分通过 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管 LC 组合进行分析，并采用 HCD 碎裂方式，最终以 mgf 文件形式提供。该数据集以蛋白质组学为主题标签，适合关注糖尿病相关血清蛋白表达谱的研究者参考使用。
【数据集背景】
该数据集归属于内分泌系统疾病/糖尿病分类，主题标签为蛋白质组学。从分类归属看，其应用背景指向内分泌系统疾病尤其是糖尿病方向的研究；从技术路线看，它属于基于 iTRAQ 标记的定量蛋白质组学分析。血清是临床蛋白质组研究中常用的样本类型，而该数据集针对的是去 depleted 血清样本，即经过高丰度蛋白去除处理的血清，这一处理通常用于降低高丰度蛋白对低丰度蛋白检测的遮蔽效应。关于该数据集的具体研究目的、课题背景与生物学假设，源站未提供。
【数据内容】
数据集英文名为 D11_iTRAQ，包含 D11_2 与 D11_3 两组 8 plex iTRAQ 分析。样本类型为去 depleted 血清样本。数据文件为 mgf 格式，对应经 SCX 分级收集的组分。8 plex iTRAQ 标记方案意味着可在一次分析中并行比较多个样本标记，但具体标记了哪些样本、各组的设计与重复安排，源站未提供。除 mgf 文件外是否包含其他类型的原始文件或结果文件，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源站为 omicsdi.org。数据采集使用 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管 LC 组合进行分析，碎裂方式为 HCD。样本经 SCX 分级后，各组分分别进行 LC-MS/MS 分析，采集所得数据以 mgf 文件形式提供。关于样本收集地点、伦理审批信息、临床资料以及具体实验操作参数（如梯度、色谱柱规格、质谱分辨率设置等），源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于蛋白质组学相关的数据再分析、方法学参考与教学演示等场景，尤其适合关注血清去 depleted 样本 iTRAQ 定量分析流程的研究者。结合其内分泌系统疾病/糖尿病分类，可作为该方向血清蛋白质组研究的参考数据。关于该数据集是否已用于特定疾病标志物发现或验证研究，源站未提供。
【使用方法】
使用者可基于提供的 mgf 文件开展蛋白质鉴定与定量分析，常见流程包括谱图文件导入、数据库搜索、iTRAQ 报告离子定量以及后续的差异分析。由于数据来自 SCX 分级组分，分析时需考虑组分间的合并与归一化处理。关于源站是否提供配套的搜索参数、蛋白鉴定结果表或定量矩阵，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 8 plex iTRAQ 分析，包含 D11_2 与 D11_3 两组，样本为去 depleted 血清，采用 Orbitrap Velos 与 Proxeon 毛细管 LC 组合及 HCD 碎裂采集数据。关于数据的覆盖度、重复性、缺失值情况、鉴定深度以及是否存在批次效应等质量指标，源站未提供。使用者应注意，mgf 文件为谱图级数据，其可用性依赖于后续搜索与定量流程的参数选择。
【引用与许可】
该数据集来源于 omicsdi.org。关于数据集的引用方式、原始发表文献、作者信息以及使用许可条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000078758
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
D11_2和D11_3是对去 depleted 血清样本进行的8 plex iTRAQ分析。这些文件是收集的SCX馏分的mgf文件，使用Orbitrap Velos-Proxeon毛细管LC组合进行分析。采用了HCD碎裂方式。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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