骨骼肌胰岛素抵抗的整合分析
该数据集来自 omicsdi.org,属于内分泌、营养和代谢疾病/糖尿病分类,主题为转录组学。数据为有无糖尿病受试者骨骼肌的转录谱,并整合四个既往数据集进行分析,旨在识别与胰岛素抵抗相关的核心基因集,并探索调控胰岛素抵抗的新通路

基本信息
资源简介
骨骼肌胰岛素抵抗的整合分析
该数据集英文名为 An integrative analysis of skeletal muscle insulin resistance,来源于 omicsdi.org,在本站归入内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病分类,主题标签为转录组学。数据集围绕骨骼肌胰岛素抵抗展开,包含有无糖尿病受试者骨骼肌的转录谱,并通过与四个既往数据集的整合分析,识别与胰岛素抵抗相关的核心基因集,进而探索调控胰岛素抵抗的新通路。整体而言,该数据集以转录组学为切入点,服务于糖尿病背景下骨骼肌胰岛素抵抗机制的研究,适合关注胰岛素抵抗分子基础、基因表达整合分析以及代谢性疾病实验模型验证的研究者参考使用。
【数据集背景】
胰岛素抵抗是糖尿病等内分泌与代谢疾病研究中的核心问题之一。该数据集的研究目标是从糖尿病患者的骨骼肌转录谱出发,识别调控胰岛素抵抗的新通路,并在胰岛素抵抗实验模型中验证其作用。围绕这一目标,研究对有无糖尿病受试者的骨骼肌进行了转录谱分析,并将自身数据与四个既往数据集进行整合分析,以确定与胰岛素抵抗相关的核心基因集。这一设计体现了从表达谱数据出发、经由整合分析提炼核心基因集、再面向通路与实验模型展开研究的基本思路。
【数据内容】
数据集的内容主体为骨骼肌的转录谱,样本来自有糖尿病与无糖尿病的受试者。主题标签为转录组学,表明数据属于基因表达层面的转录组数据。通过整合分析,数据集关联到与胰岛素抵抗相关的核心基因集;这些核心基因集是在将本数据集与四个既往数据集联合分析后识别得到的。除上述内容外,源站未提供关于样本量、基因数量、具体平台或文件格式的进一步说明。
【采集与来源】
数据来源站为 omicsdi.org。研究对象为有或无糖尿病受试者的骨骼肌,采集的是其转录谱信息。研究在自身转录谱数据之外,还整合了四个既往数据集,用于识别与胰岛素抵抗相关的核心基因集。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息以及既往四个数据集的具体来源,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与骨骼肌胰岛素抵抗相关的转录组学研究场景,例如:分析糖尿病与无糖尿病个体骨骼肌基因表达差异;借助整合分析思路识别与胰岛素抵抗相关的核心基因集;为探索调控胰岛素抵抗的新通路提供表达谱层面的依据;以及为胰岛素抵抗实验模型中的候选通路验证提供前期数据支持。其分类归属为内分泌、营养和代谢疾病 / 糖尿病,也可作为代谢性疾病转录组数据整合研究的参考数据。
【使用方法】
源站描述提到研究通过将本数据集与四个既往数据集进行整合分析来识别核心基因集,因此使用时可结合这一整合分析框架理解数据定位。关于数据的具体下载方式、文件组织、预处理步骤、分析工具与参数设置,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于有糖尿病与无糖尿病受试者骨骼肌的转录谱,并经过与四个既往数据集的整合分析,具备面向胰岛素抵抗核心基因集识别的设计基础。关于数据质量评估指标、批次效应处理情况、样本规模、平台差异以及结果的验证程度,源站未提供,使用时需结合原始来源信息自行判断。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-3420
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们旨在通过糖尿病患者骨骼肌的转录谱识别调控胰岛素抵抗的新途径,并在胰岛素抵抗的实验模型中验证其作用。我们对患有或未患有糖尿病的受试者的骨骼肌进行了转录谱分析。通过将我们的数据集与四个先前数据集进行整合分析,我们确定了与胰岛素抵抗相关的核心基因集。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




