基于血清代谢组学识别慢性肾脏病血清生物标志物
该数据集包含通过超高效液相色谱-串联质谱技术获取的194名非透析慢性肾脏病患者和317名健康对照者的血清代谢组学数据,涵盖了314种鉴定出的差异代谢物及其相关代谢通路信息,主要用于识别慢性肾脏病的潜在血清生物标志物、研究其代谢紊乱机制,并为该疾病的诊断和管理提供新的代谢组学依据。
https://figshare.com/articles/dataset/Identification_of_serum_biomarkers_for_chronic_kidney_disease_using_serum_metabolomics/27188614
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资源简介
该数据集旨在通过血清代谢组学研究识别慢性肾脏病(CKD)的生物标志物。研究收集了194名非透析CKD患者和317名健康对照者的血清样本,采用超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS)技术进行非靶向代谢组学分析,并构建了随机森林模型进行训练和验证。结果显示,CKD患者的血清代谢谱与健康对照存在显著差异,共鉴定出314种差异代谢物(其中179种上调,135种下调)。KEGG富集分析揭示了包括精氨酸生物合成、苯丙氨酸代谢、亚油酸代谢和嘌呤代谢在内的关键通路。分类器在训练集和验证集中的曲线下面积(AUC)达到1,交叉验证集中为0.9435,表现出较高的诊断效能。该研究为理解非透析CKD患者的血清代谢变化提供了全面见解,并提示异常生物代谢可能参与CKD的发病机制,探索代谢物或可为CKD的管理提供新思路。
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