GSE27162中肠类癌肿瘤表达谱
包含中肠类癌原发灶、淋巴结转移和肝转移表达谱,用于类癌进展和分型研究。由Uppsala University / GEO contributors提供,来自NCBI Gene Expression Omnibus,数据格式为表格,包含42条数据记录,适用于分类任务。

基本信息
资源简介
GSE27162中肠类癌肿瘤表达谱
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Gene expression profiling of primary tumors, lymph node and liver metastases in midgut carcinoid tumors.》。源站首次发布:Feb 08 201。
【数据内容】
源站原始描述:In order to clarify the gene expression and identify genes involved in tumor progression, gene expression profiling was performed on tumor specimens. Samples comprised 18 primary tumors, 17 lymph node (LN) metastases and 7 liver metastases. Patients were grouped according to clinical data and histopathology into indolent or progressive course. RNA was subjected to a spotted oligo microarray and B-statistics were performed. Differentially expressed genes were verified using quantitative RT-PCR. S…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL13140、9606。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE27162
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 17 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE27162
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含中肠类癌原发灶、淋巴结转移和肝转移表达谱,用于类癌进展和分型研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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