GEO 自身免疫性多腺体综合征伴原发性肾上腺功能减退B细胞单细胞转录组 (GSE192835)

艾迪生病相关综合征单细胞B细胞转录组

Weizmann Institute of ScienceWeizmann Institute of Science
Gene Expression Omnibus (GEO)
2023-01-20 更新
浏览 25
表格分类GPL2424710090
GEO Single-cell Transcriptomics of B Cells in Autoimmune Polyendocrine Syndrome with Addison's (GSE192835)

基本信息

模态
表格
大小
3.5 GB
数据量
14
任务类型
分类
许可
Open Data Commons
创建/更新时间
2023-01-20

资源简介

GEO 自身免疫性多腺体综合征伴原发性肾上腺功能减退B细胞单细胞转录组 (GSE192835)

【数据集背景】

本数据集源站标题为《RNA sequencing analysis after syngeneic graft of B16F10 tumor.》。源站首次发布:Dec 31 202。

【数据内容】

源站原始描述:It is known that melanoma of foot surface occurs more frequently at points of mechanical stress on the plantar surface. However, the role of mechanical stress on acral melanoma is not well demonstrated. To investigate the effect of mechanical stress on gene regulation, we performed RNA sequencing analysis after performing syngeneic transplantation of B16F10 mouse melanoma cell into the flank and the hind footpad of the mice

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24247、10090。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE192835

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jan 22 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE192835

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 3.50 GB。

数据说明

应用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)分析伴有艾迪生病的原发自身免疫多腺体综合征受试者外周B细胞亚群的分化规律及免疫库特征。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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