突变特征揭示结肠腺瘤中异常的TGF-β-CEA调控通路
该数据集包含结肠腺瘤组织的全基因组测序和转录组分析数据，涉及基因组和转录组等多模态信息，通过分析突变特征（如C:G>T:A替换）和调控通路（如TGF-β、CEA、Wnt），旨在揭示早期腺瘤向结肠癌转变的分子机制，为高风险腺瘤的生物标志物鉴定和早期干预策略提供研究基础。
基本信息
资源简介
突变特征揭示结肠腺瘤中异常的TGF-β-CEA调控通路
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Mutational Profiles Reveal an Aberrant TGF-β-CEA Regulated Pathway in Colon Adenomas》。配套论文《Mutational Profiles Reveal an Aberrant TGF-β-CEA Regulated Pathway in Colon Adenomas》发表于 PLOS ONE（2016），DOI：10.1371/journal.pone.0153933。源站首次发布：2016-04-21。
【数据内容】
源站原始描述：Mutational processes and signatures that drive early tumorigenesis are centrally important for early cancer prevention. Yet, to date, biomarkers and risk factors for polyps (adenomas) that inordinately and rapidly develop into colon cancer remain poorly defined. Here, we describe surprisingly high mutational profiles through whole-genome sequence (WGS) analysis in 2 of 4 pairs of benign colorectal adenoma tissue samples. Unsupervised hierarchical clustered transcriptomic analysis of a further 7…
【数据结构与技术规格】
文件数 6 个，合计 13.93 MB。S1 Dataset.XLSX：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，2.04 MB。S2 Fig.TIF：image/tiff，609.44 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0153933。
【主题与分类】
源站学科分类：Biophysics、Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。主题标签：cancer prevention、TGF、risk factors、CEA levels、tumor suppressor function、nucleotide substitutions、WGS、colorectal adenoma tissue samples、4 pairs、CRC progression。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biophysics、Medicine、Microbiology、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Mutational_Profiles_Reveal_an_Aberrant_TGF_CEA_Regulated_Pathway_in_Colon_Adenomas/3194566
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Chen, Jian; Raju, Gottumukkala S.; Jogunoori, Wilma; Menon, Vipin; Majumdar, Avijit; Chen, Jiun-Sheng; et al. (2016). Mutational Profiles Reveal an Aberrant TGF-β-CEA Regulated Pathway in Colon Adenomas. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-30，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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数据说明
该数据集聚焦于结肠腺瘤（结肠癌的早期前体病变）的突变特征与调控通路研究，旨在探索早期肿瘤发生的驱动因素。数据集包含4对良性结直肠腺瘤组织的全基因组测序（WGS）数据，以及另外7对腺瘤的转录组分析结果，揭示了以C:G>T:A单核苷酸替换为主的突变谱。研究发现，在11个腺瘤样本中，有4个存在TGF-β通路和CEA相关基因的突变，且与Wnt通路重叠；免疫组化标记显示部分腺瘤中CEA水平显著升高，同时TGF-β信号传导功能丧失。数据通过实验分析（如WGS、转录组聚类、免疫组化）构建，主要研究方向包括早期结肠腺瘤的突变过程、生物标志物（如CEA/TGF-β）的鉴定，以及高风险腺瘤向结肠癌进展的机制探索，为早期癌症预防和靶向干预提供依据。
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