非酒精性脂肪性肝炎的发生与肠道菌群相关而与氧化固醇合成无关
该数据集来自 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,属于消化系统疾病中的非酒精性脂肪性肝炎方向。源站描述指出其内容涉及氧化固醇对小鼠 NASH 模型中肠道菌群的影响

基本信息
资源简介
非酒精性脂肪性肝炎的发生与肠道菌群相关而与氧化固醇合成无关
该数据集英文名称为 Development of non-alcoholic steatohepatitis is associated with gut microbiota but not oxysterol synthesis,收录于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,所属方向为消化系统疾病中的非酒精性脂肪性肝炎。源站描述指出,其内容涉及氧化固醇对小鼠 NASH 模型中肠道菌群的影响。从名称与描述可以看出,该数据集围绕非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的发生发展机制展开,重点关注肠道菌群与氧化固醇合成两条线索之间的关系,适合作为研究 NASH 与微生物组、脂质代谢关联的参考数据资源。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
非酒精性脂肪性肝炎是非酒精性脂肪性肝病中较为严重的阶段,其发病机制涉及代谢、炎症、肠道微生态等多方面因素。该数据集的研究主题聚焦于 NASH 发展过程中肠道菌群所扮演的角色,同时考察氧化固醇合成途径是否参与其中。源站描述明确提到“氧化固醇对小鼠 NASH 模型中肠道菌群的影响”,说明该数据集的背景设定在利用小鼠模型探索 NASH 与肠道菌群、氧化固醇之间关系的实验研究框架内。主题标签为 Genomics,表明其数据组织与基因组学相关,可能涉及测序或基因组层面的信息。整体而言,该数据集服务于理解 NASH 发病机制中微生物与脂质代谢因素相对贡献的研究需求。
【数据内容】
该数据集的内容围绕小鼠 NASH 模型展开,涉及肠道菌群以及氧化固醇合成相关方面的观测。源站描述指出其关注氧化固醇对小鼠 NASH 模型中肠道菌群的影响,因此数据内容应涵盖与肠道菌群相关的信息,以及与氧化固醇合成相关的信息。数据集英文名称强调“NASH 的发展与肠道菌群相关,但与氧化固醇合成不相关”,提示其内容可能包含对这两类因素的比较性分析结果。主题标签为 Genomics,说明数据在类型上属于基因组学范畴。除上述信息外,关于样本数量、测序平台、具体菌群分类、氧化固醇种类及检测指标等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。源站描述为“Oxysterol effects on the microbiota in a murine NASH model”,表明其原始研究基于小鼠 NASH 模型,考察氧化固醇对肠道菌群的影响。数据集被归类于消化系统疾病下的非酒精性脂肪性肝炎方向,主题标签为 Genomics。关于具体的采集地点、实验机构、样本采集时间、动物品系、饲养条件、测序或检测流程等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与非酒精性脂肪性肝炎发病机制相关的研究场景,尤其是关注肠道菌群在 NASH 发展中作用的研究。由于主题标签为 Genomics,其也可用于基因组学层面的数据分析和比较。源站描述涉及氧化固醇对小鼠 NASH 模型肠道菌群的影响,因此适合用于探讨氧化固醇合成途径与肠道菌群之间关系的分析工作。此外,该数据集可用于消化系统疾病领域中对 NASH 相关微生物组或基因组学数据的二次利用。关于是否适用于临床诊断、药物开发或特定人群研究,源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 omicsdi.org 获取。关于具体的数据下载方式、文件格式、数据组织结构和分析流程,源站未提供。使用者如需利用该数据集,应参考源站所提供的说明与访问入口。关于是否需要特定工具、软件或计算环境,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,属于消化系统疾病中的非酒精性脂肪性肝炎方向。源站描述指出其内容涉及氧化固醇对小鼠 NASH 模型中肠道菌群的影响。关于数据质量评估、样本量、批次效应、缺失值情况、可重复性验证以及研究本身的局限性,源站未提供。使用者应注意,该数据集基于小鼠模型,其结论向人类 NASH 的外推需谨慎,但源站未就外推性作出具体说明。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许商业用途,源站未提供。使用者应自行查阅 omicsdi.org 上该数据集对应的页面以获取引用与许可相关信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJEB67581
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Oxysterol effects on the microbiota in a murine NASH model
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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